Endodermen, eller entodermen, är ett av de tre embryonala groddskikten som tillsammans ger upphov till kroppens alla mogna vävnader och organ. Inifrån och ut är de tre cellskikten endodermen, mesodermen och ektodermen. Cellskikten uppstår tidigt i embryonal utveckling, när en hålighet som kallas archenteron bildas i mitten av blastula, en liten boll av odifferentierade celler, och cellerna börjar omorganiseras till groddlager. Endodermen är den första som bildas och börjar bildas i det mänskliga embryot ungefär två veckor efter befruktningen. Vid den femte veckan har endodermen redan differentierats till organ.
De tre cellskikten är ungefär ekvivalenta med positionen för strukturer i den fullt formade människokroppen, med endodermen som bildar inre strukturer, ektodermen bildar yttre strukturer och mesodermen bildar mellanliggande strukturer som skelettet, skelettmuskeln och hjärtat. Vissa djur saknar mesoderm. Archenteronet är föregångaren till tarmen, eller matsmältningskanalen, och dess utseende markerar början på bildandet av bakterielagren, en process som kallas gastrulation.
Cellerna i endodermen är platta till en början, men blir kolumnformade, med deras höjd överstigande deras bredd, när de differentierar. De kommer så småningom att bilda slemhinnan i matsmältningssystemet i människokroppen, förutom delar av munnen, halsen och ändtarmen. Endodermen ger också upphov till mycket av den inre epitelvävnaden som kantar organ och körtlar.
Endodermen bildar också luftvägarna i lungorna: luftstrupen, bronkerna och alveolerna. Det fodrar alla körtlar som mynnar ut i matsmältningsröret, inklusive bukspottkörteln och levern, såväl som folliklarna i tymus, som producerar T-lymfocyter eller T-celler, och sköldkörteln, som producerar ett antal viktiga regulatoriska hormoner. Det ger också upphov till epitelet i Eustachian-röret och trumhålan i örat, och till urinblåsan och urinröret.