Magnetisk resonanstomografi (MRT) är en icke-invasiv procedur med vilken läkare formulerar en tredimensionell bild av inre kroppsstrukturer utan joniserande strålning. Läkare samlar in olika information genom att använda olika MRT-protokoll, varav de två vanligaste är T-1 MRI och T-2 MRI. Båda dessa använder elektromagnetiska vågor för att rikta in positivt laddade atomer, såsom väte, i antingen en huvud-tå-orientering för en T-1 MRI eller en vänster-höger-orientering för en T-2 MRI. En radiofrekvenspuls förskjuter sedan atomernas spinnriktning, och när pulsen avbryts återgår atomerna till sin normala inriktning och avger en signal från vilken systemet konstruerar ett eko eller en bild. T-2 MRI producerar bilder med lägre upplösning än sin motsvarighet, den T-1-vägda MRI, men den accentuerar skillnader i vätske- och cellinnehåll, vilket gör T-2 MRI-bilderna till de mest känsliga för förändringar i kroppsvävnader orsakade av cancer , inflammation och blodflödesstörningar.
T-2-vägda MRI använder selektivt ett långt intervall mellan pulser (TR), vanligtvis mellan 1500 och 300 millisekunder, och ett långt intervall mellan varje puls och analysen (TE), vanligtvis mellan 75 och 250 millisekunder. T-1-skanningen, till skillnad från T-2-skanningen, har en kort TR på endast 200 till 700 millisekunder och en kort TE-tid på 20 till 35 millisekunder. I huvudet producerar T-1-skanningar avsevärd kontrast mellan den grå substansen och den vita substansen i hjärnan och accentområdena av fett. En T-2 MRI belyser blod, vävnadssvullnad och områden med vätska.
De anmärkningsvärt starka signalerna på en T-2 MRT från vätska kan dölja vävnadsavvikelser i ett omgivande område. Till exempel producerar T-2 MRI en hyperintensiv signal från cerebrospinal i hjärnans vätskekanaler, ventriklarna. Fluid-attenuated inversion recovery (FLAIR) dämpar vätskesignalen på en T-2 MRI, vilket gör denna variant av MRI lämplig för att undersöka den periventrikulära vita substansen i hjärnan. Vid multipel skleros utvecklas plack i den vita substansen som omger ventriklarna. Identifiering av plack i hjärnan genom att använda FLAIR-bilder är avgörande för att ställa diagnosen.
Moderna MRT-maskiner samlar in data på ett sätt som gör att läkaren kan se ”skivor” av vävnad i en fram-till-baksida (sagittal), sida-till-sida (axiell) eller topp-till-botten (koronal) orientering utan patienten behöver byta position i skannern. Med dessa alternativ i orientering kan den beställande läkaren få de bästa vyerna för att visa det anatomiska området av intresse. Dessutom kan radiologer ge patienten ett injicerbart kontrastmedel, kallat gadolinium, som förändrar det lokala magnetfältet i vävnaderna. Onormal vävnad reagerar annorlunda på gadolinium än normal vävnad, vilket ger ett sätt att tydligt särskilja alla sjukdomsprocesser.