Östrogen är det hormon som dominerar den första delen av menstruationscykeln hos kvinnor, medan progesteron tenderar att dominera den andra delen, strax efter ägglossningen. Båda hormonerna måste hållas i balans för att man ska kunna bli gravid, varför det är en negativ effekt av för lite eller för mycket östrogen på fertiliteten. Att ha för lite av detta hormon kan göra att livmoderslemhinnan blir för tunn för att bära en graviditet, och kan till och med stoppa ägglossningen helt. För mycket östrogen kan orsaka en minskning av libido, och kan till och med leda till reproduktionsproblem som PCOS eller endometrios. Effekterna av östrogen på fertiliteten kan också observeras hos män, eftersom vissa uppvisar en överdriven mängd av detta hormon.
Den första halvan av menstruationscykeln styrs av östrogen, vilket gör att kroppen kan ägglossas mot mitten av cykeln. Om det inte finns tillräckligt med östrogen kommer kroppen sannolikt inte att ha ägglossning eller släppa ut ägg. En kvinna kan vanligtvis säga att hon inte har ägglossning regelbundet när hon inte märker mycket livmoderhalsslem under hela sin cykel, och slutar även att få mens varje månad, vilket gör det tydligt att det finns en negativ effekt av otillräckligt östrogen på fertiliteten. Dessutom kan hon ha värmevallningar, nattliga svettningar och huvudvärk. Låga östrogennivåer orsakas vanligtvis av att du är för smal, tränar för mycket eller har ett underliggande medicinskt tillstånd som inte tillåter frisättning av ägg.
Även om det finns en uppenbar effekt av för lite östrogen på fertiliteten, är det också känt att för mycket östrogen också kan försämra fertiliteten. Ungefär halvvägs genom cykeln, precis efter ägglossningen, bör hormonet progesteron ta över, och cykeln kommer antingen att sluta i graviditeten, eller att livmoderslemhinnan bryts ned via menstruation. För mycket östrogen kan leda till för lite progesteron och kan också orsaka medicinska problem som inte bidrar till regelbunden ägglossning, såsom endometrios, PCOS, myom och livmodercancer. Dessutom kan östrogendominans minska libido kraftigt, vilket vanligtvis leder till mindre samlag och färre chanser att bli gravida. För mycket östrogen orsakas vanligtvis av övervikt, dålig kost och för mycket stress.
Män har en liten mängd östrogen i kroppen, ofta balanserad av mycket testosteron. Vissa män gör för mycket av detta hormon, eller tar det på konstgjord väg för att lösa vissa medicinska problem. Tyvärr finns det en negativ effekt av östrogen på fertiliteten hos män, såsom låg libido och lågt spermieantal. Därför är det viktigt att fixa detta problem för att göra befruktning trolig.