Vad är DNA-utfällning?

Deoxiribonukleinsyra (DNA) utfällning är ett nyckelsteg i isoleringen och reningen av genetiskt material inom vetenskapen. I allmänhet innehåller ett prov av biologisk vävnad DNA eller RNA tillsammans med resten av organismens kropp. För att testa DNA:t måste en vetenskapsman separera DNA från alla andra substanser. DNA-fällning avser specifikt ett steg som involverar separation av löst DNA från vätskan det är löst i. Vanliga metoder för DNA-fällning inkluderar tillsats av etanol, ispropanol eller glykogen till vätskan, vilket gör att DNA:t stelnar i klumpar och faller till botten av vätskeprovet.

De första stegen i reningen av DNA från ett prov kan vara så enkla som att krossa löv i en skål för att bryta ner en del av strukturen. Då kan mäsken brytas ner med kemikalier eller enzymer som lämnar DNA:t intakt. Vanligtvis använder genetiker en centrifug för att hjälpa till att dela upp olika komponenter i ett prov. Detta är en maskin som snurrar ett prov så att den tyngsta komponenten sjunker till botten och den lättaste stiger till toppen.

Genom att ta bort olika oönskade komponenter lämnas genetikern vanligtvis med en klar vätska som innehåller det genetiska materialet. Han eller hon behöver sedan ta ut DNA:t löst i den vätskan och kassera vätskan och de andra ämnena i vätskan. DNA-utfällning är det sätt på vilket detta uppnås. Oftast behöver forskaren lägga till en kemikalie till vätskan för att utföra DNA-utfällning.

Etanol eller isopropanol, som båda är former av alkohol och ingår i lösningsmedelsgruppen av kemikalier, är de vanligaste kemikalierna som används för DNA-utfällning. Glykogen är ett annat ämne som kan fälla ut DNA, men det är mindre vanligt, förutom att fälla ut låga koncentrationer av genetiskt material. När dessa kemikalier blandas med löst DNA, tillåter deras kemi dem att förändra hur DNA passar in i sin miljö. Medan DNA tidigare blandades lätt med vätskan, slutar det efter den kemiska tillsatsen att binda till vätskan och istället formas till ett fast ämne.

Denna fasta substans är normalt vitaktig och klumpar ihop sig. Eftersom en del av det fasta ämnet fortfarande finns i små partiklar, placerar forskaren vanligtvis provet i en centrifug för att snurra ihop alla fasta ämnen till en pellet i botten av provröret. Detta är den renade formen av det DNA som ursprungligen fanns i provet, vilket är användbart för testning. I allmänhet avlägsnas vätskan som pelleten är suspenderad i från röret, och pelleten kan också torkas för att tillåta kemikalierna att avdunsta, för att göra pelleten så ren som möjligt.