En organisationsstruktur är en modell för hur en verksamhet leds och arbetet fördelas. Den typiska organisationsstrukturen för ett mjukvaruföretag beror till stor del på dess storlek. Mindre företag med en eller två platser och begränsade transaktionsvolymer kanske inte kräver komplexa strukturer. En VD eller Chief Executive Officer (VD) kan istället fördela uppgifter mellan flera personer. Strukturen hos ett företag som säljer en mängd olika produkter och som kan ha affärsintressen i olika delar av världen kräver dock normalt att en VD övervakar mer komplexa understrukturer.
En VD svarar normalt till en styrelse som godkänner beslut om ett företags organisationsförändringar. Det är vanligt i större organisationer att en VD arbetar med en Chief Operating Officer (COO). I de flesta fall övervakar dessa chefer tre olika aspekter av ett mjukvaruföretag: mjukvaruutveckling, ekonomi och marknadsföring. En chef övervakar normalt var och en av dessa funktioner.
Organisationsstrukturen kan skilja sig åt när ett mjukvaruföretag har flera geografiska platser. Istället för att dela upp en organisation i dess primära funktioner, kan en plan delegera till varje plats ansvar för sin egen ekonomi, produktion och marknadsföring. I dessa fall ser samordnare eller COO vanligtvis till att varje plats upprätthåller företagets standarder och arbetar för att uppfylla företagets mål.
Mjukvaruutvecklingsfunktioner är avgörande för ett mjukvaruföretag. Utveckling kräver ofta en egen komplex organisationsstruktur. Till exempel bör en utvecklingsgrupp ha projektledare som utses av en Chief Technology Officer (CTO). Testare, programmerare och ingenjörer spelar alla viktiga roller i mjukvaruutveckling.
Organisationsstrukturen för ett mjukvaruföretag bör också innehålla information om arbetsflöde och kommunikation. En marknadsavdelning måste kommunicera med mjukvaruutveckling för att säkerställa att projekt uppfyller kundernas förväntningar. Datornätverk har blivit en viktig del av alla organisationsstrukturer.
När ett företag växer bör dess organisationsstruktur förändras. Av denna anledning anses en struktur ofta vara i ett tillstånd av ständig förbättring. Det är vanligt att en chef analyserar processer i realtid och ändrar hur arbetet fördelas för att förbättra processer. Mjukvaruföretag tenderar att vara kunddrivna, så det är också vanligt att chefer ändrar marknadsföring för att möta behoven hos nya produkter eller intressen.
När fusioner och förvärv sker bör även organisationsstrukturen anpassas. Expansion kan också leda till att arbete och ansvar delegeras på olika sätt. Det är vanligt att strukturen innehåller åtgärder som bör vidtas vid oförutsedda händelser, till exempel miljöfaror.