Den primära motoriska cortex är en region i hjärnan som arbetar tillsammans med andra hjärnregioner för att koordinera frivilliga rörelser i hela kroppen. Den är belägen i frontalloben längs en ojämn region som kallas den precentrala gyrusen. Den primära motoriska cortexen innehåller Betz-celler, som är stora neuroner som kommunicerar genom ryggmärgens axoner med alfamotoriska neuroner. Alfamotoriska neuroner är de celler som är ansvariga för den faktiska upplevda rörelsen av kroppen. Signaler som initieras av denna cortex korsar kroppens mittlinje när de agerar, vilket betyder att en stimulering av den högra sidan av regionen styr den vänstra sidan av kroppen och vice versa.
Den primära motoriska cortex är arrangerad somatotopiskt och sammanfaller med varje större del av kroppen. Detta innebär att varje del av kroppen har en subregion i cortex och att dessa regioner är placerade logiskt bredvid varandra. Till exempel är området som styr fotens rörelser bredvid det område som är associerat med benet eller det område som kontrollerar mest rörelse på kroppens bål är beläget intill armen. Storleken på de underregioner som kontrollerar specifika kroppsdelar beror på komplexiteten i kroppsdelens handlingar. Till exempel är en av de största subregionerna i den primära motoriska cortexen dedikerad till den komplicerade verkan av händer och fingrar.
Debatten fortsätter bland forskare om i vilken utsträckning och exakt mekanism detta område verkar. Man tror att cortex inte kontrollerar enskilda muskler av sig själva. Istället verkar det styra individuella rörelser eller sekvenser av rörelser från olika muskelgrupper till att utföra en frivillig handling. Informationen som kodas i den primära motoriska cortexen är mer en abstraktion av den faktiska rörelsen som alfaneuronerna utför vid stimulering.
Den primära motoriska cortexen har visat sig hjälpa till att koda kraften i en muskelkontraktion med hjälp av information som skickas tillbaka av det perifera nervsystemet. Till exempel skiljer sig kraften som krävs för att höja armen mycket om personen håller i ett bowlingklot eller en gaffel. Förmågan hos cortex att orkestrera olika muskelgrupper samtidigt hjälper den att göra dessa typer av distinktioner. Det hjälper också kroppen att orientera och koda rörelseriktningen. Laboratoriestudier har visat att en cell i regionen kan elda starkare än sin motsvarighet när en kroppsdel flyttas i en enda riktning.