Vad är Base Excision Repair?

Basexcisionsreparation är en mekanism i cellcykeln som möjliggör reparationer av DNA:t när baspar är skadade. Skadan skapar en liten lesion som kan leda till problem i framtiden, och kroppen förlitar sig på reparation av basexcision för att åtgärda DNA-fel innan de förökar sig. Om en lesion är större, kräver den en nukleotidexcisionsreparation; detta inträffar när variationen i DNA är tillräckligt stor för att dra helixen ur form.

I denna process skär ett enzym som kallas DNA-glykosylas ut det skadade basparet. DNA följer några mycket specifika mönster, och kroppen kan känna igen en bas som inte hör hemma eftersom den innehåller felaktiga baser eller baser ur funktion. Efter excisionen finns det en liten lucka i DNA:t som måste fyllas i genom verkan av DNA-ligas och DNA-polymeras, två ytterligare enzymer.

De involverade enzymerna kan variera beroende på art. I alla fall kan cellen känna igen problemet med DNA:t och kan skicka lämpliga enzymer för att göra en reparation. Reparationen av basutskärningen kan jämföras med den för en stickare som upptäcker fel stygn. Istället för att kasta ut stickningen och ge upp kan han försiktigt ta ut sömmen och korrigera den för att återställa projektet så att han kan fortsätta arbeta med det. Liksom med stickning finns det flera sätt att reparera problemet, beroende på art och typ av fel.

DNA kan skadas på flera sätt. Oxygenering och alkylering är två vanliga bovar. Organismer som utsätts för joniserande strålning kan också utveckla skador i sitt DNA. Basexcisionsreparationen gör att kroppen kan reparera sig själv vid behov, i erkännande av det faktum att normalt slitage tenderar att skapa små fel i DNA över tiden. När cellen inte lyckas identifiera utbytta eller felaktiga baser, kan DNA:t replikera och kan förvärra felet, vilket kan ses när celler blir cancerösa på grund av förvrängning som sker i deras DNA.

Forskare studerar denna process i labbet för att lära sig mer om hur och varför det händer, och vad som händer när det går fel eller kroppen misslyckas med att identifiera ett problem med en DNA-sträng. Denna information kan vara viktig för behandling av tillstånd med en genetisk eller DNA-komponent. Det kan också vara användbart för utveckling av medicinska behandlingar som kan involvera direkt manipulation av DNA. Enzymerna som är involverade i reparation av basexcision kan också utnyttjas för att infoga eller byta ut DNA för att ta bort skadliga gener eller koda om en patients DNA för att lösa ett hälsoproblem.