Anagenes är en form av evolution där en art som helhet förändras avsevärt över tiden, så att den förfäders arten i praktiken utrotas. Detta är vad många människor tänker på när det gäller den evolutionära processen, eftersom hela generationer av arter utvecklas och förändras över tiden för att anpassa sig till miljöbehov eller förvärva nya egenskaper. När dessa förändringar inträffar, upphör den tidigare arten helt enkelt att existera, eftersom förändringen sker genom hela generationer och inte bara isolerade fickor av en artpopulation. Anagenes står i motsats till kladogenes, som är en form av evolution där en del av en art förändras till att bli en ny art.
Även kallad fyletisk evolution eller förändring, anagenes är den form av evolution som inträffar när en hel art förändras till en annan. När mänskligheten har utvecklats från till exempel primater har varje art förändrats och anpassats till olika behov för att bli en ny art. Homo sapiens som existerade nu kom troligen från Homo erectus, men evolutionsprocessen inträffade för hela arten, vilket lämnade Homo erectus att dö ut. Samma anagenesprocess kan ses hos andra djur, där forntida arter har utvecklats till nyare arter och i själva verket dött ut i processen.
Vikten av anagenes ligger i det faktum att den kan användas för att förstå hur arter utvecklas i sin helhet, och varför vissa arter slutar utrotas. Sådana evolutionära förändringar sker på en mängd olika sätt, men de är inte begränsade till fickor av en artpopulation. När den dokumenteras på ett visuellt sätt tar anagenes vanligtvis formen av en enda linje med en lutning som visar förändringar i en art över tiden. Detta i motsats till kladogenesis, som ofta avbildas i grafisk form som en linje som förgrenar sig för att producera nya linjer.
Kladogenes, till skillnad från anagenes, är en evolutionsprocess där någon del av en population förändras och utvecklas, men inte hela arten eller generationen. Detta lämnar den ursprungliga arten mer eller mindre intakt, vilket gör att både den äldre arten och den nya arten kan samexistera. Testet för evolution från en art till en helt ny och unik art är vanligtvis huruvida de två arterna kan para sig med varandra eller inte. I kladogenesis kan den resulterande arten fortfarande inte häcka med den ursprungliga arten; anagenes är inte föremål för detta test, eftersom den tidigare arten har dött ut under evolutionens period.