Allogen översätts direkt till ordet homolog. Båda är adjektiv som betyder hänvisar till vävnad, benmärg eller blod, i någon form av transplantation eller transfusion, det vill säga från samma art. Dessa termer står i kontrast till autolog, vilket innebär att man använder en av dessa vävnader från samma person till samma person. En person som får sin egen vävnad omtransplanterad eller utbytt genomgår en autolog procedur. När en allogen transplantation utförs kommer den donerade vävnaden från samma art, till skillnad från någon annan form av djurarter (xenograft) eller från dem själva (autolog).
I de flesta fall är transplantation av vävnader, blod eller andra typer av celler allogena. Detta innebär ändå att en viss grad av matchning måste ske innan man sätter in i en kropp det som levde i en annan. Även en blodgivning måste kontrolleras för att bekräfta att den inte kommer i konflikt med mottagarens blodgrupp. Avstötning av en autolog blodtransplantation kan inträffa om blodet inte är helt matchat. Detta betyder inte alltid att blodtyperna måste matcha exakt. O-positivt blod kanske kan ta emot de flesta andra typer av blod, men O-negativt blod kan vanligtvis bara ta emot O-negativt.
Mer exakt matchning kan behövas för saker som allogena benmärgstransplantationer eller organtransplantationer. Det är därför läkare ofta söker bland familjemedlemmar efter en lämplig matchning för benmärg eller organ som människor kan donera hela eller delar av, såsom njurar eller lever. Ju närmare matchen är, desto mindre är sannolikheten för avslag. Då och då görs lämpliga matchningar utanför familjen, och för vissa organtransplantationer görs nästan alltid matchningar utanför familjen, såsom hjärttransplantationer.
Vad som bör förstås är att oavsett om en transplantation eller transfusion har sitt ursprung i en persons familj eller kommer från utan den, så länge den kommer från en annan människa är den allogen. Om det kommer specifikt från den som behöver transplantationen/transfusionen så beskrivs det annorlunda. Ta till exempel en person som inte kan göra blodtransplantationer. I det här fallet kan en kirurg besluta sig för att samla in blod som förlorats under en operation och återtransfundera det i personens kropp. Detta skulle vara autologt.
På samma sätt kan insamling av benmärg vid födseln, vanligtvis genom insamling av sladd, ge en möjlighet för personer som senare utvecklar cancer att använda sin egen märg. Det skulle vara en perfekt match. Detta skulle inte vara allogent utan skulle vara autologt. Att samla in ägg för senare befruktning kan också anses vara autologt, men när de väl befruktats skulle de också vara allogena och innehålla det genetiska materialet från ytterligare en person.
Enkelt uttryckt, homologt eller allogent medelvärde från samma art. Givaren kan vara en nära släkting eller inte. Nära matchning av genetik är fortfarande vanligtvis mycket viktig men detta innebär inte relation. Två saker som en homolog inte kan vara är jaget eller en medlem av en annan art.