Tarif agen perjalanan tergantung pada jenis produk perjalanan yang mereka jual, jumlah konsultasi yang mereka tawarkan kepada klien, dan keahlian mereka sendiri. Dalam situasi di mana agen perjalanan menjual produk perjalanan kepada klien yang membayar sedikit atau tanpa komisi, seperti tiket pesawat, tarif biasanya ditetapkan untuk memastikan bahwa agen perjalanan diberi kompensasi yang adil atas waktunya. Biaya dan tarif untuk layanan konsultasi lebih mungkin bergantung pada pengalaman yang dimiliki agen perjalanan dalam menyediakan layanan perjalanan atau pengetahuannya tentang wilayah geografis atau jenis perjalanan tertentu. Tarif agen perjalanan juga dapat diatur sesuai dengan biaya hidup di wilayah tempat agen perjalanan beroperasi.
Dengan munculnya layanan perjalanan berbasis Internet, banyak vendor perjalanan seperti maskapai penerbangan, hotel dan operator paket telah mengurangi atau menghilangkan komisi yang dibayarkan kepada konsultan dan agen perjalanan. Akibatnya, para pakar perjalanan ini harus menetapkan tarif agen perjalanan agar tetap dalam bisnis. Dalam beberapa kasus, tarif ini berlaku untuk memberi kompensasi kepada agen perjalanan yang menjamin layanan perjalanan tanpa komisi atau komisi rendah untuk kliennya. Tarif dan biaya ini dapat diabaikan dalam situasi di mana pelanggan perjalanan membeli produk perjalanan lain yang memberi agen komisi yang cukup. Misalnya, jika klien memesan perjalanan ke luar negeri dan membeli tiket pesawat, paket resor, dan layanan transportasi darat, agen perjalanan dapat membebaskan biaya pemesanan standarnya untuk tiket pesawat karena ia akan menerima komisi yang cukup besar dari pembelian perjalanan lainnya.
Beberapa tarif agen perjalanan dimaksudkan untuk memberi kompensasi kepada agen perjalanan berpengalaman atas waktu mereka dalam meneliti pilihan perjalanan dan memberikan saran kepada klien. Tarif ini biasanya dikenakan sebagai cara untuk melindungi agen perjalanan dari menghabiskan waktu untuk menasihati calon klien tentang pilihan perjalanan hanya untuk kehilangan komisi apa pun ketika klien memesan perjalanannya secara langsung atau dengan agen perjalanan lain. Biaya bervariasi sesuai dengan jenis penelitian yang akan dilakukan agen perjalanan atas nama kliennya serta apakah agen perjalanan harus mengeluarkan biaya tambahan untuk mengamankan opsi perjalanan seperti melakukan panggilan telepon internasional atau mengirim faks ke berbagai vendor perjalanan . Seperti halnya biaya tiket pesawat, biaya ini terkadang akan dibebaskan oleh agen perjalanan jika klien melakukan pembelian yang signifikan.