Beberapa faktor paling umum yang dapat mempengaruhi ketebalan lapisan rahim termasuk ketidakseimbangan hormon dan siklus menstruasi yang pendek secara tidak normal. Seorang wanita mungkin juga mengalami masalah dengan ketebalan lapisan rahimnya karena obat kesuburan yang dia konsumsi atau gangguan suplai darah ke rahim. Kondisi yang secara langsung mempengaruhi organ reproduksi ini serta infeksi dan jaringan parut mungkin juga berperan.
Di antara masalah paling umum yang mempengaruhi ketebalan lapisan rahim adalah yang melibatkan hormon. Untuk kesehatan reproduksi, hormon wanita biasanya harus tetap seimbang. Lapisan rahim seorang wanita dapat terpengaruh secara negatif ketika kadar estrogen dalam tubuhnya terlalu rendah, dan hormon progesteron juga dapat mempengaruhi lapisan tersebut. Misalnya, jika seseorang memiliki terlalu sedikit progesteron dalam tubuhnya, mungkin saja dia mengalami kondisi yang disebut hiperplasia endometrium, yang ditandai dengan penebalan lapisan rahim yang berlebihan. Terlalu sedikit progesteron juga dapat menyebabkan lapisan wanita luruh terlalu cepat selama siklus menstruasinya.
Masalah lain yang dapat mempengaruhi ketebalan lapisan rahim adalah perdarahan menstruasi yang tidak normal. Ketika siklus menstruasi seorang wanita pendek secara tidak normal atau dia mengalami pendarahan yang tidak normal sepanjang siklusnya, lapisan tersebut mungkin tidak akan pernah tumbuh setebal yang diharapkan. Ini sangat penting ketika seorang wanita mencoba untuk hamil, karena lapisan yang cukup tebal sangat penting untuk keberhasilan implantasi sel telur yang telah dibuahi.
Aliran darah yang tidak mencukupi ke rahim juga dapat mempengaruhi ketebalan lapisan rahim wanita. Ada berbagai masalah yang dapat mengganggu aliran darah ke organ ini. Di antara yang paling umum adalah tekanan darah tinggi (yang juga disebut sebagai hipertensi), gangguan pembekuan darah, dan kadang-kadang kondisi yang disebut sindrom ovarium polikistik, yang ditandai dengan kista ovarium multipel.
Terkadang obat yang digunakan seorang wanita untuk meningkatkan peluangnya untuk hamil juga dapat mengganggu penebalan lapisan rahim. Misalnya, beberapa obat kesuburan mengubah proses yang dilalui tubuh untuk memproduksi hormon dan mempersiapkan kemungkinan kehamilan. Dengan demikian, beberapa obat ini mengencerkan lapisan rahim. Ini dapat diperbaiki, dalam beberapa kasus, dengan mengambil obat yang berbeda, dengan menghentikan penggunaannya, atau dengan melengkapi dengan estrogen ekstra.
Apa pun yang berdampak buruk pada rahim dapat menyebabkan perubahan ketebalan lapisan rahim. Misalnya, seseorang mungkin memiliki lapisan rahim yang menipis sebagai akibat dari operasi pada rahim atau infeksi rahim. Jaringan parut pada rahim juga dapat menyebabkan masalah ini.