Dalam biologi, domain adalah klasifikasi tertinggi organisme. Menurut sistem modern, yang disebut sistem tiga domain, dibuat oleh Carl Woese pada tahun 1990, ada tiga: Eucaryota (eukariota), Archaea, dan Bakteri. Sistem yang lebih tua termasuk sistem dua kerajaan, Prokariota dan Eukaryota, dan sistem enam kerajaan, daftar Protista, Archaebacteria, Eubacteria, Fungi, Plantae, dan Animalia. Berdasarkan analisis genetik dan argumen yang cermat, sebagian besar ilmuwan telah sepakat bahwa sistem saat ini paling baik mengklasifikasikan keanekaragaman kehidupan.
Sistem Woese telah dipuji karena menekankan keragaman mikroba, dan mengenali perbedaan mendasar antara archaea dan bakteri, cukup untuk menjamin menempatkan mereka di domain yang berbeda. Sistem dua kerajaan dikatakan mengabaikan perbedaan ini, sedangkan sistem enam kerajaan terlalu menekankan perbedaan jamur, tumbuhan, dan hewan, yang semuanya eukariota, terbuat dari sel kompleks dengan organel dan inti. Semua hewan multiseluler adalah eukariota.
Pembagian paling mendasar dalam semua kehidupan adalah antara prokariota, atau sel sederhana, dan eukariota, atau sel kompleks. Perbedaan gen 16S rRNA di antara prokariota menyebabkan mereka dipecah menjadi kelompok archaea dan bakteri, sementara perbedaan genetik lainnya memperjelas perbedaan antara kelompok ini dan eukariota.
Saat ini, tidak diketahui domain mana yang merupakan garis keturunan organisme tertua di dunia, meskipun bukti terbaru menunjuk ke archaea. Dalam hal biomassa, bakteri adalah yang paling banyak, kemungkinan diikuti oleh archaea, kemudian eukariota. Jika bakteri dan archaea menghilang, eukariota kemungkinan akan punah, karena sebagian besar eukariota sangat bergantung pada organisme lain ini untuk makanan atau interaksi simbiosis, seperti fiksasi nitrogen. Pada manusia, bakteri lambung simbiosis diperlukan untuk memecah karbohidrat kompleks.
Archaea adalah kelompok terbaru yang dikenali, diidentifikasi berbeda pada tahun 1977. Awalnya, organisme ini ditemukan di lingkungan yang ekstrim, seperti mata air panas di Yellowstone Park, tetapi sejak itu ditemukan hampir di mana-mana. Archaea termasuk beberapa extremophiles yang paling mengesankan, yang berarti organisme yang berkembang dalam suhu ekstrim, keasaman, tekanan, konsentrasi gula, kekurangan oksigen, atau variabel lainnya.