Pengobatan tungau marmot biasanya mudah dan efektif. Namun, penting untuk mendapatkan diagnosis yang akurat dari dokter hewan, karena ada kondisi lain dengan gejala yang sama. Dua suntikan obat anti-parasit – sering dipisahkan oleh satu atau dua minggu – biasanya cukup untuk membunuh parasit. Dosis ekstra mungkin diperlukan dalam kasus yang lebih sulit. Penting juga untuk membersihkan kandang marmot secara menyeluruh setelah dibersihkan dari tungau untuk mencegah infeksi ulang.
Tungau babi Guinea adalah masalah umum, terutama karena parasit kadang-kadang dapat masuk ke kandang pada makanan atau jerami hewan. Ada kesalahpahaman bahwa hanya marmot yang dipelihara di luar yang dapat menderita tungau, tetapi kondisi ini juga dapat memengaruhi hewan peliharaan di rumah. Gejala tungau marmot termasuk gatal dan iritasi yang konstan. Jika kondisi ini tidak segera diobati, menggaruk terus-menerus dapat menyebabkan rambut rontok dan kulit berkeropeng. Babi Guinea yang menderita tungau seringkali sensitif terhadap sentuhan dan mungkin sulit untuk diangkat.
Langkah pertama dalam mengobati tungau adalah untuk mendapatkan diagnosis profesional. Pada tahap awal, tungau dapat menyebabkan gejala yang mirip dengan kondisi lain, seperti kurap, yang juga dapat menyebabkan gatal. Seorang dokter hewan harus dapat membedakan antara tungau dan parasit lainnya menggunakan berbagai tes. Kutu juga bisa disalahartikan sebagai tungau, meskipun kutu mungkin tidak menyebabkan tingkat gatal yang sama.
Sebagian besar kasus tungau marmut relatif mudah diobati. Hewan itu biasanya disuntik dengan obat anti-parasit — sering kali obat yang dikenal sebagai ivermectin — yang membunuh parasit. Agar efektif, pengobatan biasanya perlu diberikan setidaknya dua kali dengan jeda dua minggu antara suntikan. Dalam kasus yang parah, suntikan tambahan mungkin diperlukan. Bentuk alternatif obat anti-parasit tidak memerlukan suntikan dan dapat dioleskan langsung ke kulit.
Penting juga untuk membersihkan kandang setelah marmot menerima pengobatan untuk tungau. Ini mencegah infeksi ulang melalui tungau yang mungkin bersembunyi di jerami atau alas kandang. Sebagai aturan umum, tempat tidur di kandang kelinci percobaan harus diganti setidaknya dua kali seminggu, dan kandang harus dibersihkan secara menyeluruh seminggu sekali. Hampir tidak mungkin untuk mencegah marmot terkena tungau, karena mereka sulit dikenali dan dapat dengan mudah masuk ke kandang, tetapi pembersihan secara teratur akan sangat mengurangi kemungkinannya.