Obat terbaik untuk bakterial vaginosis biasanya adalah obat resep. Antibiotik, baik yang diminum atau dimasukkan ke dalam vagina, biasanya efektif untuk menyingkirkan bakteri penyebab vaginosis bakterial. Bagi kebanyakan wanita, antibiotik oral adalah pengobatan terbaik untuk kasus bakterial vaginosis, karena antibiotik yang dimasukkan ke dalam vagina seringkali kurang efektif. Kadang-kadang seorang wanita juga dapat mempertimbangkan pengobatan rumah untuk vaginosis bakteri, tetapi pengobatan rumahan biasanya tidak dapat diandalkan untuk mengobati infeksi bakteri tertentu ini.
Dalam kebanyakan kasus, obat terbaik untuk kasus bakterial vaginosis adalah antibiotik yang disebut metronidazol, yang sering dijual dengan merek Flagyl®. Metronidazol biasanya diresepkan dalam bentuk pil, tetapi dapat diberikan melalui vagina juga. Bentuk gel yang dimasukkan ke dalam vagina untuk pengobatan vaginosis bakterial disebut sebagai Metrogel®. Wanita juga dapat menggunakan gel yang disebut klindamisin sebagai alternatif Metrogel®. Perlu juga dicatat, bagaimanapun, bahwa beberapa kasus bakterial vaginosis hilang dengan sendirinya.
Secara umum, metronidazol oral lebih efektif untuk mengobati vaginosis bakterial daripada aplikasi vagina. Namun, dalam beberapa kasus, seorang wanita mungkin lebih memilih obat yang diberikan melalui vagina meskipun faktanya sedikit kurang efektif daripada obat oral. Hal ini disebabkan oleh fakta bahwa beberapa orang telah melaporkan efek samping yang tidak menyenangkan saat menggunakan metronidazol. Efek samping dapat terjadi dengan gel vagina juga, tetapi biasanya kecil dan kecil kemungkinannya untuk berkembang.
Meskipun metronidazol biasanya dianggap sebagai obat terbaik untuk bakterial vaginosis, ada antibiotik lain yang juga terbukti efektif. Salah satu pengobatan alternatif untuk bakterial vaginosis disebut tinidazole. Meskipun mungkin tidak seefektif untuk mengobati vaginosis bakterial seperti metronidazol, ini dianggap sebagai pengobatan yang andal. Ini juga dikaitkan dengan efek samping yang lebih sedikit daripada metronidazol.
Seorang wanita mungkin juga merasa tergoda untuk mencoba pengobatan rumahan untuk bakterial vaginosis. Biasanya, bagaimanapun, pengobatan rumahan gagal, dan seorang wanita mungkin masih memerlukan perawatan medis setelah dia mencobanya. Namun, dokter biasanya merekomendasikan pengobatan, karena infeksi bakteri dapat menyebabkan komplikasi. Misalnya, bakterial vaginosis dapat menyebabkan keguguran, persalinan prematur, dan infeksi rahim setelah melahirkan. Vaginosis bakterial yang tidak diobati juga dapat berkontribusi pada perkembangan penyakit radang panggul, yang dapat menyebabkan penyakit parah dan infertilitas permanen.