Meskipun tidak ada cara yang sangat mudah untuk sepenuhnya menghindari keracunan makanan dari kerang, ada beberapa langkah yang harus diambil untuk membuat konsumsi relatif aman. Keracunan makanan dari kerang paling sering terjadi ketika mengkonsumsi kerang dari air yang mungkin terkontaminasi oleh pasang merah atau yang baru saja terkontaminasi. Industri kerang komersial diatur, dan operasinya diperiksa secara teratur, membuat sebagian besar kerang yang disiapkan secara komersial aman untuk dimakan. Kebanyakan keracunan makanan dari kerang terjadi ketika amatir mengumpulkan dan memakan kerang yang terkontaminasi. Makan kerang mentah atau setengah matang juga berisiko.
Seperti makanan lainnya, kerang dapat terkontaminasi bakteri dan mikroorganisme berbahaya melalui penanganan yang tidak tepat. Kerang harus selalu diperoleh dari sumber yang memiliki reputasi baik. Jangan pernah makan kerang jika tidak yakin dengan sumbernya. Makanan laut apa pun harus disiapkan dengan tangan yang dicuci dan peralatan yang bersih dan di ruang kerja yang bersih. Memasak kerang secara menyeluruh akan membunuh banyak mikroorganisme berbahaya.
Terkadang kerang mungkin mengandung racun yang stabil terhadap panas dan tidak dapat dihilangkan melalui pemasakan. Sebaiknya hindari makan kerang selama bulan-bulan musim panas yang hangat, terutama jika gelombang merah sudah parah. Selama pasang merah, populasi fitoplankton menjadi sangat banyak sehingga tubuh mereka menyebabkan air tampak kemerahan. Racun alami diproduksi yang dapat dicerna oleh kerang. Karena kerang adalah filter feeder, tubuh mereka dapat mengakumulasi racun dan menyebabkan penyakit pada manusia atau hewan yang memakannya.
Keracunan makanan dari kerang juga dapat terjadi ketika kerang terkontaminasi dengan virus hepatitis A atau Norwalk. Selain itu, ada empat jenis keracunan kerang yang dikenali dari akumulasi toksin alami. Keracunan kerang amnesia dan neurotoksik dapat menyebabkan penyakit, tetapi tidak ada kematian yang diketahui. Wabah keracunan kerang amnesia tahun 1987 di Kanada timur memiliki tingkat kematian 3 persen. Keracunan kerang paralitik adalah yang paling mematikan, dengan tingkat kematian 1 hingga 12 persen.
Populasi tertentu berada pada peningkatan risiko keracunan makanan dari kerang. Ini termasuk anak-anak dan orang tua, terutama jika mereka memiliki sistem kekebalan yang terganggu. Sebagian besar kasus keracunan kerang sembuh dengan sendirinya, tetapi perhatian medis harus dicari jika dicurigai keracunan makanan dari kerang. Gejala dari beberapa jenis keracunan mungkin muncul dalam beberapa menit setelah mengonsumsi kerang dan termasuk kesemutan atau rasa terbakar pada bibir dan lidah, mual, dan sakit perut. Jenis keracunan kerang lainnya, seperti hepatitis A, mungkin memerlukan waktu beberapa minggu hingga gejala muncul.
Meskipun kejadian pasang merah terus meningkat, penting untuk diingat bahwa sebagian besar konsumsi kerang sangat aman. Karena kerang yang diperoleh secara komersial tunduk pada peraturan ketat mengenai praktiknya, masyarakat terus menikmati kerang tanpa kekhawatiran yang berlebihan. Secara umum, manfaat nutrisi dari mengonsumsi kerang cenderung lebih besar daripada risiko keracunan, terutama jika kerang diperoleh secara komersial dan dimasak dengan matang.