Genom manusia diurutkan oleh dua kelompok berbeda dalam dua cara berbeda. Proyek Genom Manusia (HGP) senilai $3 miliar Dolar AS (USD), didukung oleh Departemen Energi AS, menggunakan teknik yang disebut “pengurutan senapan hierarkis”, di mana ia memecah genom manusia menjadi beberapa bagian yang masing-masing terdiri dari 150,000 pasangan basa. Potongan-potongan ini kemudian dimasukkan ke dalam bakteri di mana mesin replikasi DNA bakteri membuat banyak salinan sampel untuk memudahkan pengurutan. Konstruksi ini disebut kromosom buatan bakteri. Proyek ini didirikan pada tahun 1990 dan membutuhkan waktu 13 tahun untuk diselesaikan, dan berakhir pada April 2003. “Draf kasar” genom manusia tersedia pada April 2000.
Kelompok lain, Celera Genomics, menggunakan pendekatan yang relatif baru yang disebut sekuensing senapan seluruh genom untuk mengurutkan genom manusia dalam waktu yang jauh lebih singkat dan dengan biaya yang jauh lebih rendah ($300 juta USD) daripada HGP yang didanai pemerintah federal. Kelompok ini dimulai pada tahun 1998 dan selesai pada tahun 2001. Sekuensing senapan lengkap melibatkan pemecahan banyak salinan genom menjadi bagian-bagian yang lebih kecil secara acak, mengurutkan bagian-bagian itu, dan kemudian menentukan bagian mana yang terhubung dengan melihat di mana kodon tumpang tindih. Algoritma superkomputer dan pengurutan memberikan kontribusi yang tak ternilai bagi pendekatan Celera, membuatnya layak. Sebelum pekerjaan Celera, genom terbesar yang diurutkan melalui pendekatan senapan keseluruhan adalah sekitar 13 juta pasangan basa, jauh di bawah tiga miliar pasangan basa genom manusia. Penting untuk dicatat bahwa proyek Celera tidak dimulai dari awal seperti yang dilakukan HGP; itu dapat mengakses informasi yang ada yang telah diterbitkan sebelumnya di GenBank, kumpulan urutan genetik dan data yang tersedia untuk semua.
Meskipun genom manusia mengandung tiga miliar pasangan basa, hanya 3 persen kode untuk protein (97 persen lainnya adalah DNA sampah), menciptakan total sekitar 25,000 gen. Ini kecil dibandingkan dengan perkiraan 40,000 hingga 2,000,000 gen yang dilemparkan sebelum penyelesaian proyek. Keterbatasan kode genetik manusia berarti bahwa suatu hari nanti, para peneliti dapat memahami gen manusia secara keseluruhan dan bahkan memanipulasinya.
Pekerjaan terus menganalisis pekerjaan yang keluar dari HGP. Inisiatif terbaru adalah menemukan cara untuk mengurutkan genom manusia dengan harga kurang dari $1,000 USD, yang akan membuat teknologi ini layak untuk digunakan lebih luas. Urutan tunggal dapat menentukan banyak karakteristik genetik penting dari orang tersebut, termasuk kemungkinan Anda mengembangkan penyakit tertentu. Craig Venter, mantan pemimpin proyek Celera, telah mengurutkan genomnya sepenuhnya dan telah berbicara dengan berbagai media tentang hasil dan implikasinya.