Prosedur yang terlibat dalam pembuatan antibiotik tergantung pada apakah suatu produk alami, semi-sintetis, atau sepenuhnya sintetis. Obat alami dibuat dengan mengolah mikroorganisme dalam kondisi terkendali dan mengumpulkan senyawa yang mereka ekspresikan, sementara produk semi-sintetik melibatkan langkah tambahan untuk memodifikasi bahan kimia yang diproduksi secara alami. Sintetis, seperti obat sulfa, dibuat dengan proses manufaktur kimia. Produksi antibiotik dalam semua kasus memerlukan lingkungan yang steril dengan pemantauan yang konstan untuk memeriksa tanda-tanda kontaminasi yang dapat mengganggu produksi obat yang aman.
Antibiotik alami memerlukan persiapan kultur mikroorganisme, seperti jamur, yang mengekspresikan antibiotik sebagai produk sampingan. Mereka ditanam di tangki fermentasi besar dengan makanan agar mereka tetap bereproduksi. Seorang ahli mikrobiologi mengawasi proses, mengontrol suhu, kelembaban, dan kondisi lain untuk meningkatkan hasil. Diperlukan beberapa hari untuk menyiapkan kaldu antibiotik yang perlu dijalankan melalui sistem penyaringan untuk memurnikan dan mengekstrak obat. Pengujian meyakinkan personel bahwa produksi antibiotik tidak terkontaminasi, dan obatnya cukup kuat untuk dijual ke publik.
Obat semi-sintetik menambahkan langkah untuk ini. Alih-alih memurnikan dan mengemas produk alami, staf di fasilitas manufaktur memperlakukannya dengan proses kimia. Langkah dalam produksi antibiotik ini mengubah struktur obat. Ini tidak sepenuhnya sintetis, karena didasarkan pada produk alami, tetapi bukan produk yang sama dengan yang mungkin ditemukan di alam liar. Obat-obatan ini mungkin lebih ganas terhadap organisme yang lebih luas, atau dapat memiliki efek samping yang lebih sedikit daripada bentuk alaminya. Ampisilin adalah contoh antibiotik semi-sintetik.
Obat sintetis dibuat dengan reaksi kimia, dimulai dengan bahan baku yang dimodifikasi dalam lingkungan yang terkendali. Produksi antibiotik melalui proses sintetik dapat lebih mudah dikontrol, karena tidak tergantung pada variasi alami organisme hidup yang digunakan dalam tangki fermentasi. Masih memerlukan pemantauan yang cermat untuk memeriksa kontaminasi dan menghasilkan obat yang murni dan konsentrasi standar.
Seperti obat-obatan lainnya, produksi antibiotik diatur oleh pemerintah. Agen dapat memeriksa fasilitas produksi dan batch produk dengan kekuatan untuk menarik obat jika ada kekhawatiran tentang keamanan atau kemanjuran. Mereka juga dapat meminta log yang mendokumentasikan pengujian dan prosedur kontrol kualitas, untuk mengonfirmasi bahwa perusahaan memiliki standar internal yang jelas dan mengikutinya setiap saat.