Penatalaksanaan neutropenia pada anak bervariasi berdasarkan penyebab kondisi ini. Jika masalah medis ini disebabkan oleh obat-obatan, maka penggunaan obat akan dihentikan atau dosisnya akan diturunkan untuk melihat apakah hal ini berdampak positif pada neutropenia. Ketika neutropenia disebabkan oleh infeksi parah, biasanya bertahan dalam jangka waktu yang lama, antibiotik atau obat-obatan akan diberikan untuk mengatasi gejala dan memungkinkan pasien untuk pulih lebih cepat. Untuk neutropenia berat, biasanya disebabkan oleh kesalahan dalam produksi neutrofil di sumsum tulang, pengobatan terdiri dari faktor perangsang koloni granulosit (G-CSF) untuk meningkatkan sintesis neutrofil. Ketika respon autoimun terhadap neutrofil menyebabkan neutropenia pada anak-anak, pengobatannya adalah dengan menekan sistem kekebalan tubuh dengan menggunakan steroid.
Banyak obat kemoterapi dapat mengekang aktivitas sumsum tulang dan menurunkan produksi neutrofil, yang menyebabkan neutropenia. Perawatan yang paling umum untuk penyebab ini adalah mengurangi atau menyebarkan perawatan obat atau, jika mungkin, menghentikan sepenuhnya penggunaan obat sampai neutropenia sembuh. Jika hal ini tidak memungkinkan, anak-anak akan sering dirawat di rumah sakit untuk meminimalkan risiko infeksi, mengamati dengan cermat tanda-tanda infeksi, dan diobati dengan antibiotik profilaksis. Orang tua dari anak-anak yang menderita neutropenia jenis ini perlu diberi daftar tanda-tanda infeksi atau tanda-tanda bahwa neutropenia memburuk dan mengawasi anak mereka dengan waspada.
Infeksi yang berkepanjangan atau parah, terutama pada bayi dan anak-anak, dapat melemahkan tubuh dan menguras neutrofil, menyebabkan neutropenia pada anak-anak. Bila hal ini terjadi, anak akan diobati dengan antibiotik yang kuat untuk mempercepat penghancuran penyerbu asing. Obat-obatan juga dapat diresepkan untuk mengurangi gejala dan memungkinkan anak untuk mendapatkan istirahat yang cukup untuk membangun kembali tubuhnya. Bila neutropenia pada anak sangat parah, anak dapat dirawat di rumah sakit agar antibiotik intravena dapat diberikan dan kondisi anak dapat diamati dengan cermat.
Neutropenia pada masa kanak-kanak, yang disebabkan oleh defek pada sintesis neutrofil, diobati dengan memulai pengobatan G-CFS. G-CFS adalah hormon sintetis yang memulai produksi neutrofil oleh sumsum tulang. Perawatan ini diberikan, biasanya sekali sehari, melalui suntikan intravena. Neutropenia pada anak-anak yang disebabkan oleh respon autoimun yang menghancurkan neutrofil biasanya diobati dengan steroid. Obat ini menekan sistem kekebalan dan memungkinkan tubuh untuk membangun kembali konsentrasi neutrofil.
Gejala neutropenia pada anak seringkali sulit dibaca. Ketika seorang anak telah dirawat dengan obat kemoterapi atau obat lain yang diketahui menyebabkan neutropenia, orang tua harus waspada terhadap tanda-tanda infeksi. Jika ditemukan, dokter anak atau ahli onkologi harus segera dipanggil. Tanda paling umum dari neutropenia pada anak-anak adalah menjadi sering sakit dan dengan tingkat keparahan yang lebih tinggi. Beberapa anak mungkin juga mengalami gusi bengkak atau berdarah.