Suhu tubuh basal seorang wanita selama kehamilan akan tetap sedikit meningkat dari saat pembuahan sampai sekitar akhir trimester pertama. Dalam kebanyakan kasus, peningkatan kecil dalam suhu istirahat ini tidak terlihat kecuali dengan penggunaan termometer basal, yang dapat secara akurat membaca suhu tubuh hingga 0.1°F (0.18°C). Banyak wanita menggunakan sedikit fluktuasi suhu tubuh basal untuk menentukan kapan mereka paling subur dan kemudian sebagai indikator awal kehamilan.
Meskipun ada fluktuasi normal dalam suhu tubuh basal, selama kehamilan umumnya antara 0.4 dan 1.0 °F (0.072 dan 0.18 °C) lebih tinggi daripada antara periode wanita dan waktu ovulasinya. Jika suhu tubuh basal wanita tetap tinggi selama lebih dari 15 hari atau lebih setelah ovulasi, ini bisa menjadi indikasi awal bahwa dia hamil. Negatif palsu tidak jarang terjadi pada tes kehamilan, tetapi suhu yang stabil dan sedikit meningkat dari waktu ovulasi terakhir selama dua minggu atau lebih merupakan indikator kuat bahwa wanita tersebut telah hamil. Selama waktu ini, tes kehamilan seringkali tidak dapat diandalkan, sehingga banyak wanita menggunakan suhu ini untuk menentukan apakah mereka mungkin hamil atau tidak.
Suhu tubuh basal akan tetap pada tingkat yang sedikit meningkat ini selama trimester pertama kehamilan normal. Pada akhir trimester pertama, suhu wanita kembali normal. Peningkatan tajam mungkin merupakan indikasi bahwa dia sedang melawan infeksi atau penyakit.
Banyak wanita menggunakan suhu tubuh basal untuk membantu mereka menentukan siklus kesuburan mereka. Suhu biasanya cukup konsisten antara akhir periode seorang wanita dan ovulasi berikutnya. Saat seorang wanita berovulasi, suhu tubuh basalnya akan turun beberapa sepersepuluh derajat dan kemudian meningkat tajam, antara 0.4 dan 1°F (0.072 dan 0.18°C). Suhu akan tetap tinggi sampai wanita itu memulai menstruasinya, di mana siklus dimulai lagi. Jika seorang wanita telah hamil, suhu tubuhnya harus tetap tinggi, sehingga penurunan suhu ini merupakan indikator kuat bahwa dia belum hamil selama siklus ovulasi tertentu.