Kiat terbaik untuk membuat makaroni dan keju rendah lemak termasuk menggunakan gandum utuh atau pasta gandum utuh, menambahkan keju rendah lemak, dan mencampurkan sedikit jika ada mentega atau margarin. Susu skim juga bisa diganti dengan susu murni dalam jenis hidangan rendah lemak ini. Banyak resep untuk makaroni dan keju rendah lemak termasuk bahan penyedap sehat lainnya, seperti bawang karamel, mustard Dijon, atau bubuk cabai. Meskipun beberapa orang mungkin berpikir bahwa makan makanan rendah lemak berarti mengorbankan rasa, hidangan pasta favorit ini bisa sama memuaskannya jika dimasak dengan produk rendah lemak berkualitas baik.
Makaroni dan keju sering dibuat dengan pasta putih yang mengandung pati dalam jumlah tinggi serta kalori kosong. Mengganti pasta whole wheat, penne, atau rotini akan dengan mudah meningkatkan nilai gizi makaroni dan keju rendah lemak. Selain lebih sedikit pati dan lemak, pasta gandum juga memiliki lebih banyak serat dan protein yang sehat. Begitu beberapa juru masak mencoba makaroni dan keju dengan pasta gandum utuh, mereka merasa lebih menyukainya daripada hidangan yang dibuat dengan pasta tepung putih.
Koki yang mencoba membuat hidangan pasta rendah lemak memiliki beberapa pilihan keju. Makaroni dan keju biasa terkadang dibuat dengan produk keju olahan yang mengandung konsentrasi tinggi lemak jenuh tidak sehat, serta pengawet buatan. Keju rendah lemak yang lebih sehat untuk jenis hidangan ini termasuk ricotta, Parmesan, keju cottage, dan sedikit cheddar rendah lemak yang diparut. Beberapa juru masak juga suka menambahkan mozzarella susu skim parut, meskipun terlalu banyak keju yang meleleh ini dapat menyebabkan makaroni saling menempel.
Beberapa resep untuk makaroni dan keju rendah lemak meminta untuk menghilangkan mentega yang biasanya digunakan untuk menjaga pasta yang dimasak agar tidak menggumpal. Karena pasta gandum utuh tidak mengandung pati yang menyebabkan masalah ini, pasta ini biasanya tidak memerlukan tambahan mentega. Banyak resep makaroni dan keju rendah lemak menginstruksikan juru masak untuk menuangkan saus keju yang sudah disiapkan ke atas pasta gandum yang baru dimasak. Campuran keju sering kali terdiri dari susu skim, tepung serbaguna, dan keju rendah lemak pilihan yang dipanaskan dan diaduk bersama di atas api sedang dalam panci kompor.
Perasa tambahan untuk makaroni dan keju rendah lemak termasuk bawang merah matang atau bawang merah. Koki yang menyukai pilihan makanan rendah lemak yang lebih pedas sering mencampurkan bubuk cabai merah, saus pedas, atau lada hitam dalam takaran takaran. Remah roti rasa juga merupakan topping populer untuk jenis resep makaroni dan keju ini.