Sel manusia sangat terspesialisasi untuk melakukan jutaan tugas spesifik yang memungkinkan manusia tidak hanya hidup di lingkungan biologisnya tetapi juga mengubah lingkungan tersebut sesuai keinginannya. Ratusan jenis sel manusia yang berbeda diperlukan untuk melakukan tugas yang bervariasi ini. Mengklasifikasikan jenis sel manusia dapat dilakukan pada banyak set kriteria termasuk sumber asalnya, fungsi jaringan atau sistem atau pola hidup sel.
Mengklasifikasikan jenis sel manusia berdasarkan sumbernya dilakukan dengan mempelajari perkembangan manusia atau embriologi. Tiga lapisan germinal primer berkembang dari pembelahan sel ovum yang dibuahi dalam enam sampai delapan hari pertama. Lapisan terluar, ektoderm, pada akhirnya akan membentuk sel-sel epidermis, termasuk kulit, kuku, dan rambut, serta sistem saraf. Lapisan dalam, endoderm, menjadi lapisan epitel sistem pencernaan dan kelenjar serta jaringan terkait. Mesoderm, di antara dua lapisan lainnya, menghasilkan sel-sel sistem otot dan kerangka, dan sistem limfatik dan pembuluh darah.
Histologi atau studi tentang jaringan, mengklasifikasikan jenis sel manusia berdasarkan fungsi jaringan primer. Sel epitel ditemukan di seluruh tubuh, termasuk kulit dan di lapisan atau penutup bagian dari saluran pencernaan dan jantung, kelenjar, pembuluh darah dan lokasi lain yang membutuhkan perlindungan halus dan padat. Sistem pencernaan mencakup beberapa jenis sel khusus, seperti nefron di ginjal, vila usus kecil, dan sel hati. Sel-sel sistem peredaran darah dan pernapasan cukup beragam, termasuk sel darah merah dan putih dan alveoli paru-paru.
Sistem otot, kerangka dan artikular mengontrol bagaimana manusia bergerak. Sel-sel otot terdiri dari tiga jenis: halus, lurik atau jantung. Sel rangka terutama sel tulang dan tulang rawan. Sistem artikular mencakup sel-sel jaringan ikat yang membentuk ligamen dan tendon.
Neuron adalah sel utama dari sistem saraf dan dicirikan oleh kemampuan untuk menerima dan mengirimkan sinyal kimia. Sistem sensorik mencakup banyak sel khusus seperti sel retina di mata, dan sel penginderaan tekanan dan panas di kulit. Pendengaran dicapai dengan serangkaian rumit konduksi suara fisik melalui tulang dan melalui kepala gendang dan koneksi ke sistem saraf melalui getaran sel-sel rambut khusus telinga bagian dalam. Sistem lain dengan sel khusus termasuk sistem reproduksi, endokrin, limfatik, dan saluran kemih.
Jenis sel manusia juga dapat diatur oleh fase siklus sel yang ada di dalamnya. Sel-sel labil memiliki rentang hidup yang spesifik dan pada dasarnya bereproduksi secara konstan. Ini termasuk sel-sel saluran pencernaan, sumsum tulang dan alveoli paru-paru.
Sel-sel yang stabil dapat bereproduksi sesuai kebutuhan tubuh. Sel hati akan beregenerasi seperlunya sementara sel ginjal tidak bisa. Sel jaringan permanen dianggap tak tergantikan oleh tubuh dan termasuk lensa mata dan sel darah merah sebagai contoh. Sel induk dan neuron somatik dulu termasuk dalam kategori ini tetapi telah terbukti mampu beregenerasi. Semua sel ini masih tunduk pada penuaan tubuh individu melalui mekanisme yang kurang dipahami.