Banyak jenis muffin bebas gluten tersedia bagi mereka yang menyukai muffin tetapi memiliki alergi gluten, penyakit Celiac, atau intoleransi gluten. Gluten adalah protein yang ditemukan di beberapa biji-bijian dan kadang-kadang dalam bahan kue, jadi muffin bebas gluten dibuat dengan modifikasi untuk mengganti bahan dengan protein ini. Muffin ini bisa manis atau gurih, dengan banyak bahan dan rasa yang berbeda. Banyak pilihan tersedia dalam wadah yang sudah dikemas sebelumnya, segar dari toko roti, atau sebagai resep untuk dibuat di rumah.
Muffin bebas gluten manis termasuk yang mengandung cokelat atau yang mengandung buah. Contoh populer termasuk muffin chip coklat bebas gluten atau muffin blueberry bebas gluten. Banyak dari pilihan ini dapat ditemukan pra-campuran di bagian khusus dari beberapa toko kelontong. Varietas lain juga ada yang mengeksplorasi berbagai kombinasi buah.
Muffin bebas gluten dari varietas gurih tidak sering ditemukan dalam wadah yang sudah dikemas sebelumnya. Namun, ketika kesadaran akan intoleransi gluten dan alergi meningkat, hal ini dapat berubah. Contoh muffin gurih termasuk miso labu atau wortel dan muffin bawang. Muffin gurih juga bisa termasuk, atau disajikan dengan, keju.
Secara budaya, muffin di AS sering dianggap berbentuk cupcake besar. Salah satu variasi bentuk ini adalah muffin Inggris bebas gluten. Muffin Inggris berbentuk pipih, dan bisa gurih atau manis, tergantung bahan dan olesannya. Muffin Inggris bebas gluten dapat dibeli dalam kemasan atau dapat dibuat di rumah dengan resep.
Beberapa toko roti sekarang menawarkan muffin bebas gluten bagi mereka yang memiliki sedikit waktu atau tidak suka memasak. Toko roti bebas gluten menawarkan berbagai resep varietas manis dan gurih. Toko roti ini beroperasi baik di perusahaan batu bata dan mortir dan online, bagi mereka yang tidak memiliki akses ke fasilitas bebas gluten.
Resep bebas gluten umumnya menggantikan tepung terigu tradisional. Pengganti tepung dapat dibeli dalam kemasan yang sudah jadi. Pilihan lain untuk membuat muffin bebas gluten adalah mengganti tepung terigu dengan tepung lain yang tidak mengandung gluten. Contoh dari alternatif tepung ini termasuk tepung kelapa, tepung almond dan tepung beras merah, meskipun mereka menambahkan rasa yang berbeda dan seringkali perlu digabungkan dengan beberapa jenis bahan pengikat, seperti xanthan gum.
Soda kue dan baking powder kadang-kadang mengandung gluten, jadi tindakan pencegahan khusus harus dilakukan saat menggunakan bahan-bahan ini untuk membuat muffin bebas gluten. Beberapa soda kue dan bubuk sekarang menunjukkan apakah mereka bebas gluten atau tidak, sementara beberapa tidak memiliki indikasi. Penelitian cepat biasanya dapat membantu mengidentifikasi pilihan terbaik untuk soda kue dan bubuk bebas gluten sebelum dimasak.