Kloning terapeutik melibatkan replikasi sel dan jaringan tubuh untuk penggunaan medis. Implikasi kloning untuk kondisi yang beragam seperti organ yang gagal dan fungsi jaringan yang rusak sangat menjanjikan, seperti nilai untuk penelitian ilmiah secara keseluruhan. Oleh karena itu, banyak organisasi ilmiah dan medis terkemuka mendukung kloning sel, tetapi sejumlah kritikus — ilmiah dan lainnya — mengutuk praktik tersebut. Mereka berpendapat bahwa aktualitas kloning terapeutik tidak memenuhi janji, dan dalam beberapa kasus mungkin terbukti berbahaya. Lebih penting lagi, lawan mengatakan, kloning terapeutik menimbulkan beberapa pertanyaan etis yang serius tentang hidup dan mati.
Embrio dapat menghasilkan sel induk unik yang mampu dipupuk menjadi semua jenis sel organ atau jaringan. Jika seorang pasien memiliki jantung yang rusak, sel-sel kloning dapat digunakan untuk membuat sel-sel pemukulan yang sehat dari jaringan jantung. Seseorang yang menderita luka bakar parah dapat diobati dengan sel kulit kloning daripada prosedur cangkok kulit yang menyakitkan dan tidak terduga. Jika seseorang menderita cedera tulang belakang, sel-sel saraf yang dikloning mungkin suatu hari memungkinkan orang itu berjalan lagi. Yang disebutkan di atas hanyalah beberapa dari kemungkinan manfaat yang dapat diberikan oleh kloning.
Lebih diharapkan lagi, potensi penolakan dalam transplantasi organ sangat berkurang karena organ yang baru dikloning akan berasal dari sel individu yang terkena penyakit itu sendiri. Kemajuan kloning manusia berlipat ganda setiap tahun, tetapi para ilmuwan telah mencapai beberapa keberhasilan dalam mengkloning babi atau jaringan hewan lain untuk tujuan medis. Karena babi memiliki sistem organ yang mirip dengan manusia, mamalia menjadi kandidat ideal untuk penelitian dasar dan bahkan transplantasi organ.
Para pendukungnya menggembar-gemborkan penggunaan kloning di lingkungan rumah sakit, tetapi potensi penelitian medis secara keseluruhan bahkan lebih menggiurkan. Perkembangan sel adalah mata rantai penting dalam memahami kondisi kompleks seperti cacat lahir dan kanker. Jika sel kloning memberikan pemahaman yang lebih baik kepada para ilmuwan tentang perkembangan sel normal, maka dengan perluasan mereka juga akan mendapatkan wawasan tentang penyebab perkembangan sel abnormal di balik banyak cacat dan kanker. Lebih lanjut, sel kloning dapat memungkinkan manipulasi – dan kemungkinan eliminasi – penyakit genetik.
Bukti dari beberapa ilmuwan terkemuka di bidang ini, bagaimanapun, menunjukkan beberapa kelemahan serius dari kloning terapeutik. Faktanya, banyak latihan kloning medis tidak berhasil. Sejumlah besar sel kloning mengandung cacat, yang pada akhirnya mengalahkan tujuan mereka sebagai agen penyembuhan. Bahkan banyak organisme yang sepenuhnya dikloning mengalami cacat yang signifikan dan mati sebelum waktunya. Menggunakan sel dari organisme kloning dapat menciptakan harapan palsu dan, mungkin, perawatan yang salah.
Sementara kekhawatiran medis valid, bisa dibilang suara paling menonjol dari perbedaan pendapat untuk kloning jenis apapun muncul dari individu yang bersangkutan kloning embrio. Sama seperti pendukung dan penentang aborsi yang berbeda pendapat tentang masalah kapan kehidupan dimulai, pertanyaan yang sama memicu perdebatan sengit seputar kloning. Kritikus berpendapat bahwa embrio kloning tidak boleh digunakan untuk eksperimen medis karena mereka adalah makhluk hidup yang layak dengan hak mereka sendiri. Embrio memiliki DNA dan genom lengkap; ia memiliki semua kemampuan untuk tumbuh menjadi janin manusia yang matang.
Masalah potensial yang ditimbulkan oleh kloning terapeutik dan kloning secara keseluruhan dapat diambil lebih jauh. Orang-orang beragama mungkin merasa kloning mengganggu masalah penciptaan yang sebaiknya diserahkan kepada makhluk spiritual atau alam. Jika kloning manusia penuh membuahkan hasil, organisme yang dihasilkan dapat dilucuti dari individualitas dan digunakan hanya sebagai sistem pengambilan organ untuk donor mereka. Kekhawatiran semacam itu telah menyebabkan banyak daerah melarang praktik kloning.