Istilah “seminari” dan “perguruan tinggi Alkitab” sering digunakan secara bergantian, tetapi, meskipun istilah-istilah tersebut terkait, mereka biasanya tidak sama. Sebuah perguruan tinggi Alkitab dan seminari keduanya lembaga pendidikan tinggi, dan keduanya fokus pada beberapa aspek studi tulisan suci; keduanya juga dapat memberikan gelar dalam bidang teologi atau unsur ajaran agama. Ini adalah tujuan menyeluruh dari lembaga-lembaga di mana perbedaan itu terletak. Sebagian besar waktu, perguruan tinggi Alkitab adalah lembaga sarjana yang memfokuskan pembelajaran mereka pada kitab suci dan menawarkan gelar pada topik agama, tetapi biasanya juga menawarkan gelar utama dalam seni dan sains. Seminari, di sisi lain, umumnya adalah lembaga pascasarjana yang sepenuhnya didedikasikan untuk mempersiapkan siswa menjadi pemimpin agama.
Siswa umumnya memilih untuk menghadiri sekolah Alkitab dan seminari karena alasan yang berbeda. Perguruan tinggi Alkitab biasanya disebut sebagai perguruan tinggi biasa, hanya dengan kecenderungan alkitabiah. Siswa dari latar belakang Kristen yang menginginkan komunitas kampus yang akan memelihara kepercayaan mereka sering memilih untuk menghadiri sekolah Alkitab. Seminari adalah untuk siswa yang ingin mengejar karir dalam pelayanan.
Sebagian besar perguruan tinggi Alkitab memerlukan sejumlah jam kredit dalam studi Alkitab atau kelas agama lainnya, tetapi sering kali menawarkan program gelar yang sebanding dengan sekolah sekuler. Siswa yang lulus dari perguruan tinggi Alkitab akan memiliki dasar yang kuat dalam teologi biblika, tetapi dapat mengejar berbagai jalur karir. Perguruan tinggi Alkitab biasanya tidak melatih siswa untuk panggilan khusus apa pun, melainkan bertujuan untuk memberikan pendidikan perguruan tinggi yang luas — tetapi berpusat pada alkitabiah. Gelar sarjana Alkitab bisa dalam berbagai disiplin ilmu. Sekolah Alkitab dan seminari pada dasarnya berbeda dalam hal ini.
Tujuan utama seminari adalah untuk mendidik para pemimpin gereja masa depan. Kebanyakan seminari adalah institusi tingkat pascasarjana, artinya mereka hanya menawarkan gelar master dan doktor. Gelar sarjana biasanya diperlukan sebelum menghadiri seminari. Beberapa seminari mengharuskan pelamar untuk memiliki gelar sebelumnya dalam agama atau teologi, seperti yang akan dicapai seseorang dari perguruan tinggi Alkitab, tetapi tidak semua melakukannya.
Siswa seminari mengambil kursus di seminari mereka yang disesuaikan untuk mempersiapkan mereka untuk pekerjaan tertentu di dalam gereja. Diaken, imam, dan gembala biasanya diminta untuk menjadi lulusan seminari sebelum mereka dapat ditunjuk untuk memimpin di gereja. Banyak pendeta awam juga memiliki gelar seminari.
Perbedaan lain antara sekolah Alkitab dan seminari sering kali adalah denominasi. Ada berbagai jenis perguruan tinggi Alkitab. Meskipun ada beberapa yang sangat dekat dengan gereja tertentu, banyak yang lain bersifat interdenominasi, berfokus pada sejarah alkitabiah bersama yang terpisah dari tradisi gereja tertentu. Seminari hampir selalu merupakan denominasi tunggal. Memilih perguruan tinggi Alkitab atau memilih seminari berkali-kali tergantung pada afiliasi gereja siswa.
Setiap denominasi Kristen memiliki persyaratan yang berbeda dari para pemimpinnya. Di beberapa gereja, seperti Gereja Katolik Roma, imamat diperuntukkan bagi pria. Oleh karena itu, seminari Katolik hanya terbuka untuk pria, dan pelajaran, kursus, dan gelar yang ditawarkan secara khusus bersifat Katolik. Seminari mengikuti ajaran denominasi pendiri mereka, dan biasanya mempersiapkan siswa untuk pelayanan di gereja tertentu.
Kadang-kadang, sebuah sekolah menawarkan perguruan tinggi Alkitab dan seminari. Keduanya akan sering berbagi fakultas, tetapi siswa umumnya terbatas pada satu program. Gelar perguruan tinggi Alkitab dapat mengarah ke penerimaan seminari, dan menjadi tuan rumah sekolah yang sama di satu kampus membuat transisi menjadi lebih mudah. Namun, biasanya tidak ada korelasi langsung antara menghadiri sekolah Alkitab dan seminari.