Rumah kaca dapat diberi ventilasi dengan berbagai cara, tetapi beberapa metode lebih efektif daripada yang lain. Metode terbaik ventilasi rumah kaca memungkinkan udara disegarkan dengan lembut tanpa mengganggu vegetasi lembut di dalamnya. Salah satu metode ventilasi paling sederhana adalah ventilasi yang dipasang di atap atau dinding yang memungkinkan angin alami mengalir melalui struktur. Ventilasi yang membuka dan menutup secara otomatis juga merupakan metode ventilasi rumah kaca yang baik. Kipas knalpot dan sirkulasi interior juga bisa menjadi cara yang efisien untuk ventilasi rumah kaca.
Ventilasi tunggal yang dipasang di dinding atau atap adalah salah satu metode ventilasi rumah kaca yang paling murah dan terbaik. Ventilasi semacam ini memungkinkan udara segar mengalir melalui struktur dari pintu atau jendela yang terbuka. Metode ventilasi rumah kaca ini memungkinkan udara mengalir secara bertahap melalui ruangan dan menghilangkan panas dan kelembapan. Rumah kaca yang lebih besar biasanya membutuhkan serangkaian ventilasi yang ditempatkan secara strategis di sepanjang atap atau dinding. Ventilasi dinding louvered dapat dibuka secara manual untuk memberikan aliran udara tambahan saat tidak ada angin bertiup.
Ventilasi otomatis membuka dan menutup ketika suhu di dalam rumah kaca mencapai tingkat tertentu. Metode ventilasi rumah kaca ini bekerja tanpa listrik. Silinder yang terpasang membuka ventilasi secara otomatis ketika jumlah panas yang cukup menumpuk di sekitarnya. Ventilasi menutup lagi ketika udara di dalam rumah kaca telah mendingin. Ventilasi otomatis yang dioperasikan secara elektrik dikendalikan oleh termostat atau pelembap yang disetel ke suhu atau tingkat kelembapan tertentu.
Exhaust fan juga dapat memberikan ventilasi rumah kaca dengan menarik udara luar melalui struktur ketika tidak ada angin alami. Kipas angin ini biasanya dipasang di seberang pintu untuk memungkinkan udara mengalir sepenuhnya melalui struktur. Karena udara dari kipas angin bertiup ke luar, itu tidak mengganggu tanaman halus. Rumah kaca kecil biasanya dapat berventilasi hanya dengan satu unit dinding. Struktur yang lebih besar mungkin memerlukan satu atau lebih kipas buang besar yang dipasang di setiap ujungnya dengan ventilasi louver di dinding samping.
Exhaust fan dapat dikontrol secara manual atau otomatis dengan menggunakan thermostat atau humidistat. Kipas angin bertenaga surya juga dapat dibeli untuk membantu mengurangi konsumsi energi. Unit-unit ini memiliki biaya awal yang lebih tinggi tetapi biasanya membayar sendiri seiring waktu dengan menurunkan biaya listrik. Beberapa rumah kaca menggunakan kipas interior yang dikombinasikan dengan kipas buang untuk lebih mengedarkan udara dan mengurangi suhu dan kelembapan. Metode ventilasi rumah kaca ini juga membantu mendorong penyerbukan di antara jenis tanaman tertentu.