Ada sejumlah masalah umum yang dapat mempengaruhi kesehatan iguana. Beberapa masalah kesehatan iguana yang paling menonjol termasuk penyakit tulang metabolik, pengikatan telur dan batu kandung kemih. Banyak dari masalah kesehatan ini, bagaimanapun, dapat dihindari dengan mempraktikkan perawatan iguana yang tepat.
Masalah kesehatan iguana yang paling umum adalah penyakit tulang metabolik (MBD), yang terutama ditemukan pada iguana penangkaran. MBD biasanya terjadi ketika pemilik iguana baru diberi informasi diet yang salah. Misalnya, banyak pemilik baru disuruh memberi makan selada ke iguana mereka. Meskipun selada memberikan kelembapan yang signifikan, selada kekurangan vitamin dan mineral yang dibutuhkan iguana. Jika iguana hanya makan selada, bubuk vitamin-mineral dapat ditambahkan sebagai saus topikal.
Masalah kesehatan iguana lain yang umum adalah pengikatan telur. Ini terjadi ketika iguana betina hamil tidak dapat mengeluarkan telur dari saluran reproduksi. Ini dapat terjadi sebagai akibat dari kekurangan gizi atau telur yang cacat. Perawatan untuk pengikatan telur termasuk pembedahan dan pengobatan.
Batu kandung kemih juga merupakan masalah yang sangat umum terkait dengan kesehatan iguana. Urin pada iguana mengandung mineral yang biasanya dipecah secara alami, tetapi jika tidak dipecah, mereka akan mulai menumpuk, yang dapat menyebabkan batu kandung kemih berkembang. Iguana mungkin menjadi lesu dan mulai mengejan saat buang air kecil. Jika batu kandung kemih terus tumbuh, perut iguana bisa membengkak. Ekstraksi batu kandung kemih yang berhasil hanya dapat dicapai melalui pembedahan.
Lecet pada hidung juga merupakan masalah kesehatan iguana yang umum. Seekor iguana bisa mendapatkan abrasi hidung dengan membenturkan hidungnya ke dinding kandangnya. Ini biasanya terjadi karena iguana berusaha keluar dari kandang. Seiring waktu, abrasi dapat berkembang di hidung dan dapat menyebabkan cedera yang lebih serius.
Luka bakar adalah masalah kesehatan umum lainnya yang terkait dengan iguana. Banyak pemilik iguana membeli bola lampu dan lampu pemanas untuk memberi hewan peliharaan mereka sumber cahaya dan panas, tetapi produk ini dapat merusak kesehatan iguana. Jika iguana tidak berhati-hati, ia bisa terbakar saat bersentuhan dengan produk ini. Namun, luka bakar dapat dicegah dengan memasang perangkat pelindung pada atau di sekitar produk yang berpotensi berbahaya.