Konferensi video menjadi lebih dan lebih dari pilihan populer di dunia bisnis dan pendidikan, karena kenyamanan dan penghapusan biaya perjalanan. Namun, ada beberapa kelemahan konferensi video yang perlu diingat juga. Pertama, kapan pun teknologi digunakan, kesulitan teknis harus dihadapi; ini dapat berkisar dari masalah perangkat lunak, masalah dengan perangkat keras komputer itu sendiri, atau bahkan gangguan di sekitarnya yang membuat sulit untuk mendengar atau melihat, seperti kebisingan sekitar di kantor. Beberapa orang juga merindukan hubungan pribadi yang terjadi dalam suasana yang lebih tradisional, seperti jabat tangan dan kontak mata, yang hilang dalam konferensi video.
Biaya untuk mengatur teknologi ini adalah salah satu kelemahan konferensi video yang lebih umum. Bisnis yang memiliki banyak biaya perjalanan untuk karyawan akan sering menganggap proses ini sepadan, tetapi beberapa bisnis kecil mungkin menganggap biaya konferensi video menjadi penghalang. Bisnis juga perlu merencanakan di mana mereka akan memasang konferensi video; misalnya, ruang konferensi adalah pilihan yang baik, tetapi ruang yang sama tidak dapat digunakan untuk rapat jika konferensi video sedang berlangsung. Meskipun mungkin bukan kerugian konferensi video, masalah logistik seperti ini adalah sesuatu yang perlu dipikirkan.
Masalah teknis adalah beberapa kelemahan konferensi video yang paling umum. Gangguan perangkat lunak cukup umum, yang mungkin memerlukan panggilan ke dukungan teknis, mengganggu seluruh jadwal konferensi. Kamera atau mikrofon di komputer juga bisa gagal. Selain itu, beberapa kantor mungkin mengalami masalah yang tidak terduga, seperti suara bising yang masuk dari luar. Ada banyak cara agar konferensi video dapat terganggu yang biasanya tidak menjadi masalah selama konferensi langsung.
Salah satu kelemahan konferensi video utama adalah kurangnya kontak pribadi. Saat mencoba mengembangkan hubungan bisnis, atau bahkan saat mewawancarai seseorang untuk suatu pekerjaan, penting untuk melihat bagaimana orang tersebut menangani dirinya sendiri dalam situasi profesional. Jabat tangan yang erat dan kontak mata yang bersahabat adalah beberapa cara terbaik untuk menentukan hal ini, tetapi konferensi video mencegahnya. Karena teknologi terus meningkat, ini mungkin tidak akan menjadi masalah, tetapi tetap tidak akan ada pengganti untuk bertemu seseorang secara langsung. Tentu saja, keuntungan konferensi video biasanya lebih besar daripada beberapa kerugiannya, tetapi untuk beberapa kesempatan tidak ada pengganti untuk pertemuan orang ke orang yang kuno.