Minyak pohon teh, atau minyak melaleuca, berpotensi dapat mengobati beberapa masalah kesehatan yang berbeda, meskipun mungkin paling dikenal karena kemampuannya untuk membunuh bakteri dan jamur. Meskipun banyak manfaatnya, namun ada beberapa efek samping minyak pohon teh yang harus diketahui konsumen sebelum digunakan. Ketika tertelan, dapat menyebabkan masalah kesehatan yang parah, dan beberapa orang alergi minyak pohon teh meskipun hanya digunakan secara topikal sesuai petunjuk. Jika digunakan dalam kombinasi dengan obat-obatan yang dapat mempengaruhi kulit, kekeringan parah adalah salah satu efek samping minyak pohon teh yang paling umum. Dalam beberapa kasus, dapat menyebabkan perubahan hormonal pada anak laki-laki ketika dikombinasikan dengan minyak lavender.
Umumnya, minyak pohon teh dianggap aman bagi kebanyakan orang bila digunakan secara topikal; Namun, hal ini tidak benar ketika tertelan. Jika tertelan, minyak pohon teh bisa menjadi racun, dan berpotensi menyebabkan koma. Dalam kebanyakan kasus, efek samping minyak pohon teh saat tertelan termasuk disorientasi, kehilangan kendali atas anggota badan, dan munculnya ruam yang menyakitkan. Ketika minyak pohon teh dikonsumsi, perhatian medis segera diperlukan.
Seperti kebanyakan perawatan kulit topikal, ada beberapa orang yang alergi atau sensitif terhadap minyak pohon teh. Iritasi di situs aplikasi adalah salah satu indikator utama bahwa seseorang alergi, termasuk gatal, kemerahan, dan peradangan. Reaksi alergi yang sebenarnya terhadap minyak pohon teh dapat menyebabkan jenis masalah kesehatan yang sama dengan reaksi alergi lainnya, termasuk kesulitan bernapas dan munculnya gatal-gatal.
Salah satu efek samping minyak pohon teh yang paling umum terjadi ketika dikombinasikan dengan obat lain yang menyebabkan kekeringan pada kulit. Dalam banyak kasus, minyak pohon teh digunakan untuk mengobati jerawat, dan dapat membantu membunuh bakteri penyebab jerawat serta mengeringkan jerawat yang ada sehingga lebih cepat sembuh. Ketika dikombinasikan dengan obat jerawat lain yang bekerja serupa, seperti asam salisilat dan benzoil peroksida, kekeringan yang berlebihan dapat terjadi, yang dapat menyebabkan pengelupasan, gatal, atau ketidaknyamanan yang ekstrem.
Kombinasi pohon teh dan minyak lavender dapat menyebabkan anak laki-laki mengembangkan jaringan payudara berlebih. Sampai tahun 2011, para peneliti belum menemukan mengapa hal ini terjadi, meskipun beberapa orang percaya bahwa kombinasi kedua produk tersebut menyebabkan perubahan pada hormon anak laki-laki. Meskipun ada beberapa produk yang mengandung kedua minyak ini, efek samping ini dapat terjadi bahkan jika kedua minyak tersebut tidak terkandung dalam produk yang sama, tetapi seseorang menggunakan dua produk yang mengandung salah satu minyak pada saat yang bersamaan.