Kesehatan seksual remaja, meskipun bukan topik yang banyak anak-anak usia ini ingin diskusikan dengan orang dewasa, adalah masalah yang sangat penting. Ini adalah tahun-tahun yang sangat formatif, dan kebiasaan-kebiasaan yang dipelajari selama masa remaja sering kali dapat melekat pada seseorang seumur hidup. Beberapa isu yang paling penting mengenai kesehatan seksual remaja termasuk perubahan fisik tubuh dan pendidikan seks.
Selama dan setelah pubertas, remaja akan mulai melihat banyak sekali perubahan fisik. Anak laki-laki, misalnya, akan sering mulai menumbuhkan rambut wajah, dan penis mereka biasanya akan tumbuh sedikit lebih besar. Anak perempuan, di sisi lain, biasanya akan menyadari bahwa payudara mereka menjadi lebih besar, dan mereka akan mulai mengalami periode menstruasi bulanan. Perubahan fisik ini terutama disebabkan oleh hormon.
Hormon-hormon ini juga sebagian bertanggung jawab atas meningkatnya minat berhubungan seks. Dalam hal kesehatan seksual remaja, berhubungan seks adalah salah satu masalah terbesar. Remaja harus dididik tentang seks secara umum serta risiko dan konsekuensinya. Sebagian besar sekolah di Amerika Serikat memiliki semacam program pendidikan seks. Sementara mengajar remaja tentang seks mungkin menjadi topik yang kontroversial bagi sebagian orang, seringkali hal itu perlu untuk membantu mencegah penyakit menular seksual dan kehamilan yang tidak direncanakan.
Materi tentang penyakit menular seksual (PMS) banyak dijumpai di kelas-kelas yang mengajarkan tentang kesehatan seksual remaja. PMS tertentu, seperti klamidia, dapat menyebabkan kemandulan, jika tidak ditangani dengan benar. Lainnya, seperti AIDS, bisa berakibat fatal. Remaja yang menduga mereka mungkin telah tertular PMS sering dapat mencari bantuan dari klinik kesehatan seksual. Klinik-klinik ini menawarkan sejumlah layanan kesehatan seksual, mulai dari tes PMS hingga kontrasepsi.
Kontrasepsi, atau pencegahan kehamilan, juga merupakan masalah kesehatan seksual remaja yang penting. Remaja yang tidak dididik dengan baik mengenai konsekuensi seks jauh lebih mungkin mengalami kehamilan yang tidak direncanakan. Beberapa klinik kesehatan seksual dan bahkan beberapa perawat sekolah menawarkan kondom gratis kepada remaja yang aktif secara seksual. Kondom lateks sering dianggap sebagai salah satu cara terbaik untuk mencegah PMS dan kehamilan yang tidak direncanakan, kedua setelah pantang.
Beberapa orang percaya bahwa mengajari remaja tentang seks dan membagikan kontrasepsi gratis hanya akan membuat mereka berhubungan seks lebih awal. Di sisi lain, beberapa individu berdiri pada keyakinan bahwa remaja akan berhubungan seks dengan atau tanpa pendidikan seks dan kontrasepsi. Namun, banyak ahli kesehatan percaya bahwa memberikan pendidikan tentang masalah kesehatan seksual remaja tertentu sejak dini dapat menurunkan tingkat PMS dan kehamilan yang tidak direncanakan pada remaja.