Dalam dunia kedokteran hewan, vaksin inti adalah vaksin yang sangat dianjurkan, bahkan terkadang diperlukan. Protokol vaksin untuk berbagai hewan termasuk anjing, kucing, dan kuda biasanya dibagi antara vaksin inti dan non-inti sehingga praktisi veteriner dapat memastikan bahwa pasien mereka mendapatkan vaksin yang mereka butuhkan. Untuk pemilik hewan peliharaan, penting untuk mengetahui secara spesifik bahwa vaksin yang direkomendasikan adalah vaksin inti, karena ini akan menekankan pentingnya menerima vaksin, bersama dengan booster lanjutan.
Pada kucing dan anjing, rabies mungkin merupakan vaksin inti yang paling umum, karena rabies dipandang sebagai risiko yang serius. Pada kucing, virus leukemia kucing (FeLV) adalah vaksin inti umum lainnya, terutama untuk kucing yang keluar rumah. Vaksin inti lainnya dapat ditambahkan ke jadwal vaksin, tergantung di mana hewan itu tinggal. Pada kuda, penyakit seperti penyakit tidur, virus West Nile, dan tetanus biasanya dimasukkan dalam daftar vaksin inti.
Sebaliknya, vaksin non-inti hanya direkomendasikan, dan mungkin tidak diperlukan dalam semua kasus. Biasanya dokter hewan menggunakan pedoman regional yang dikeluarkan oleh asosiasi profesional untuk memutuskan vaksin mana yang akan diberikan, dan mereka dapat mendiskusikan opsi non-inti dengan klien mereka. Sebagai contoh, jika seekor hewan banyak makan, disarankan untuk mendapatkan vaksin non-inti untuk bordetella, yang juga dikenal sebagai batuk kennel, tetapi jika seekor hewan tetap berada di dalam ruangan dan tidak pernah naik, vaksin bordetella tidak diperlukan.
Beberapa wilayah di dunia secara khusus mengharuskan hewan menerima vaksin inti tertentu. Vaksin yang paling umum diperlukan adalah rabies, karena keinginan untuk mengendalikan kejadian rabies di seluruh dunia. Di negara-negara di mana tidak ada rabies, seperti Inggris Raya, semua hewan yang masuk ke negara tersebut harus datang dengan dokumen yang menunjukkan bahwa mereka telah menerima vaksin rabies, dan telah diuji untuk memastikan adanya antibodi. Saat mendiskusikan pilihan vaksinasi, dokter hewan biasanya akan memastikan bahwa pemilik mengetahui vaksin inti mana yang diperlukan, dan mana yang sangat direkomendasikan.
Ketika mengevaluasi vaksin inti mana yang harus dimasukkan dalam jadwal vaksin, pejabat biasanya melakukan analisis biaya-manfaat untuk menentukan apakah manfaat vaksin lebih besar daripada risiko vaksinasi. Sementara vaksinasi terus berkembang lebih aman, mereka membawa beberapa risiko kesehatan, dan analisis ini dirancang untuk memperhitungkannya. Pemilik hewan peliharaan harus selalu melaporkan reaksi merugikan terhadap vaksin secepat mungkin, baik untuk alasan statistik maupun untuk memberikan waktu kepada perusahaan untuk menarik kembali vaksin, jika mereka menentukan bahwa banyak yang telah dikompromikan.