Terapi sel induk jantung digunakan untuk menggantikan dan memperbaiki sel-sel yang rusak di pembuluh darah dan dinding bilik dan pembuluh darah jantung. Terapi yang menggunakan jaringan jantung pasien sendiri yang dirangsang untuk membuat sel punca sedang dalam tahap pengujian dan studi medis mulai tahun 2011. Salah satu bidang medis utama yang menggunakan terapi sel punca jantung adalah dalam perbaikan kerusakan jantung manusia akibat serangan jantung dan penyakit jantung degeneratif.
Prosedur untuk menyelesaikan terapi sel induk jantung dimulai dengan pengambilan sejumlah kecil jaringan dari jantung orang yang telah menderita serangan jantung atau yang mengalami kerusakan sel jantung akibat penyakit jantung. Dalam lingkungan laboratorium, jaringan yang dipanen dibagi untuk mendapatkan sel punca, yang dirangsang untuk berkembang biak menjadi beberapa juta sel punca dalam waktu dua bulan sejak proses dimulai. Sel induk yang tumbuh kemudian dikembalikan ke pasien dan dimasukkan ke dalam area jantung yang rusak menggunakan balon kateter untuk mendapatkan akses ke ruang organ.
Jenis sel jantung tertentu ditargetkan dalam terapi sel induk yang diketahui merespons pertumbuhan dengan baik di laboratorium. Sel-sel kardiomiosit diperbaiki dan diganti dalam terapi sel induk jantung dan penting, karena mereka membentuk otot yang menggerakkan darah keluar dari ventrikel jantung. Terapi juga digunakan dalam upaya untuk memperbaiki sel-sel yang membentuk lapisan dalam dan dinding pembuluh darah baru. Setelah kerusakan sel akibat penyakit jantung, sel punca yang mendorong perkembangan pembuluh darah baru penting dalam menyediakan darah dan oksigen ke jantung.
Upaya memperkenalkan sel punca ke jantung yang rusak dari donor atau embrio manusia telah terbukti tidak efektif dalam banyak kasus pada 2011. Penggunaan jaringan untuk menumbuhkan sel punca yang kemudian dikembalikan ke donor asli terbukti lebih efektif dalam mengembalikan pluripoten terinduksi sel induk ke tubuh yang memperbaiki area jantung yang rusak. Proses terapi sel induk jantung dianggap lebih efektif daripada menggunakan sel sumsum tulang dalam upaya memperbaiki dinding bilik dan pembuluh darah jantung.
Terapi sel punca jantung menjadi kontroversial setelah penyempurnaan proses penghilangan sel punca dari embrio manusia. Kemampuan untuk mengembangkan sel punca dari jaringan penerima akhir telah menghilangkan sejumlah besar kontroversi pada tahun 2011, karena perkembangan baru ini telah menghilangkan penggunaan sel punca embrio manusia dari proses tersebut. Penelitian medis dalam terapi sel induk tetap kontroversial dengan aktivis hak-hak hewan karena hewan laboratorium memiliki serangan jantung dan penyakit jantung yang diinduksi di dalamnya untuk meniru masalah jantung manusia.