Resistensi klindamisin mengacu pada strain bakteri yang pernah dibunuh oleh klindamisin tetapi telah mengembangkan kekebalan terhadap obat tersebut. Bakteri adalah organisme hidup, mampu beradaptasi dengan lingkungannya untuk bertahan hidup. Terapi antibiotik membunuh bakteri yang rentan, tetapi strain bakteri yang lebih kuat tetap ada dan mengembangkan cara untuk melawan efek toksik dari antibiotik klindamisin. Saat bakteri berkembang biak dan mewariskan kekuatan adaptif kepada keturunannya, populasi bakteri mengembangkan resistensi yang luas terhadap obat tersebut. Kemampuan bakteri untuk beradaptasi dan melawan efek klindamisin disebut resistensi klindamisin.
Obat antibiotik, klindamisin dikembangkan untuk memerangi infeksi umum yang disebabkan oleh bakteri anaerob seperti malaria, infeksi kulit, toksoplasmosis, peritonitis, infeksi saluran pernapasan, dan infeksi gigi. Penyakit ini sebagian besar merupakan infeksi yang didapat dari masyarakat dan oleh karena itu terdapat dalam jumlah yang sangat besar di lingkungan yang sangat luas. Dalam lingkungan yang begitu luas, bakteri yang menyebabkan infeksi ini memiliki ruang untuk beradaptasi dan menyesuaikan diri. Tergantung pada jenis bakteri dan metode adaptasinya, bakteri dapat menetralkan efek klindamisin atau berkembang biak lebih cepat sehingga melebihi efektivitas obat.
Masalah resistensi antibiotik, termasuk resistensi klindamisin, telah menjadi masalah kesehatan dunia. Penyakit yang pernah dikalahkan melalui terapi antibiotik mengalami lonjakan jumlah, menyebar ke seluruh populasi global tanpa hambatan atau dengan alternatif pengobatan yang mahal dan sulit. Infeksi methicillin-resistant staphylococcus aureus (MSRA), atau “superbug” seperti yang sering disebut, adalah contoh resistensi klindamisin yang mengancam. Infeksi kulit yang umum dan menular ini dapat berkembang menjadi penyakit yang sangat parah, merusak daging atau fatal. Satu-satunya pengobatan untuk beberapa infeksi MSRA adalah pengangkatan bagian tubuh yang sakit atau amputasi anggota tubuh yang terkena.
Untuk mencegah efek mengerikan dari resistensi klindamisin, profesional medis menyarankan untuk menahan diri dalam penggunaan antibiotik dan pemberian obat yang tepat dengan terapi antibiotik. Klindamisin tidak cocok untuk infeksi virus seperti flu biasa, influenza, bronkitis, dan banyak infeksi telinga. Antibiotik hanya boleh diberikan untuk jenis bakteri yang terpengaruh. Pasien harus menyelesaikan seluruh dosis yang ditentukan untuk sepenuhnya membunuh semua jenis bakteri dalam tubuh.