Protein organik mencakup semua sumber protein makanan, baik dalam bentuk makanan utuh atau suplemen, yang ditanam atau dibesarkan secara organik. Untuk disertifikasi sebagai organik, umumnya harus diproduksi di tanah yang bebas bahan kimia tanpa bantuan pestisida, pupuk, antibiotik, atau aditif buatan. Seringkali, protein organik mengacu pada bubuk protein organik yang dapat dicampur dengan air atau susu untuk membentuk shake, dicampur menjadi smoothie, atau ditambahkan ke oatmeal atau makanan lain. Jenis bubuk protein termasuk protein whey, yang berasal dari susu, protein kedelai, protein rami, dan sumber protein vegetarian lainnya seperti protein kacang polong.
Sebagai suplemen makanan, protein organik dapat direkomendasikan untuk berbagai alasan, apakah untuk menambahkan protein ke diet vegetarian, untuk memulihkan setelah operasi atau cedera, atau untuk mendukung pembangunan massa otot. Vegetarian dan vegan, individu yang dietnya kurang protein hewani, mungkin disarankan untuk melengkapi dengan bubuk protein nabati seperti rami atau protein kedelai untuk menutupi kekurangan ini. Mereka yang mengangkat beban, bahkan jika mereka hanya menginginkan peningkatan tonus otot, dapat mengambil manfaat dari konsumsi protein shake segera setelah latihan, karena mempromosikan perbaikan sel-sel otot yang rusak selama sesi latihan. Faktanya, siapa pun yang perlu membangun atau memperbaiki jaringan tubuh berpotensi mendapat manfaat dari suplementasi protein.
Bentuk bubuk protein yang paling banyak tersedia adalah protein whey, yang mengandung sejenis protein yang dilepaskan sebagai produk sampingan saat susu dibuat menjadi keju. Isolat protein whey, bentuk yang biasanya ditemukan dalam bubuk protein, disebut-sebut karena kemampuannya untuk dipecah dengan sangat cepat selama pencernaan, membuatnya lebih mudah tersedia untuk digunakan oleh tubuh. Agar whey dianggap sebagai protein organik, susu tidak hanya harus organik — berasal dari sapi yang dibesarkan tanpa menggunakan antibiotik, hormon, atau bahan kimia lainnya — tetapi proses yang digunakan untuk membuat keju juga harus dilakukan secara organik.
Bentuk alternatif protein organik yang telah menjadi populer di kalangan vegetarian adalah bubuk rami. Terbuat dari biji tanaman ganja, yang sudah cenderung dibesarkan secara organik, rami dikatakan mengandung hampir semua asam amino esensial yang dibutuhkan tubuh dari sumber protein makanan. Ini dapat membantu mengatasi beberapa kekurangan nutrisi dari diet vegetarian, yang mungkin kekurangan asam amino tertentu yang biasanya hanya tersedia dalam makanan hewani.
Jenis protein organik lainnya adalah bubuk protein kedelai, yang berasal dari kedelai, salah satu produk pertanian yang paling banyak ditanam di dunia. Kedelai dari mana bubuk tersebut berasal tentu saja harus ditanam secara organik untuk dianggap sebagai protein organik. Karena dapat diproduksi dengan cukup murah, mereka mungkin merupakan bentuk bubuk protein yang lebih murah untuk vegetarian. Protein kedelai, bagaimanapun, mengandung lebih sedikit asam amino daripada protein rami dan tidak dapat dicerna dengan mudah.