Muesli bebas gluten adalah hidangan sarapan yang disajikan dengan gandum gulung mentah atau gandum gandum, kacang-kacangan, biji-bijian, susu segar, dan berbagai pemanis dan rempah-rempah untuk memunculkan rasa keseluruhan. Beberapa orang yang menjalani diet bebas gluten dapat mengonsumsi gandum dalam muesli biasa jika mereka tidak menderita penyakit celiac; Namun, ini bervariasi antara individu. Karena sebagian besar oat yang dijual secara komersial diproduksi dengan produk gandum, sebagian besar muesli yang dijual atau dibuat tidak dapat dimakan oleh penderita penyakit celiac. Muesli harus dibuat menggunakan oat bebas gluten mentah dan bersertifikat agar aman bagi mereka yang memiliki intoleransi gluten.
Muesli normal, menu sarapan sehat umum yang terbuat dari gandum mentah dan direndam, seringkali sangat rendah kandungan glutennya, protein yang ditemukan dalam gandum, hampir tidak, dan gandum hitam. Oat secara alami bebas gluten; namun, selama pemrosesan, oat sering kali terkontaminasi silang dengan gandum dan biji-bijian lain yang mengandung gluten. Hal ini dapat menyebabkan reaksi yang merugikan pada mereka dengan intoleransi gluten, dan dapat menimbulkan masalah serius pada mereka yang menderita penyakit celiac. Muesli bebas gluten dibuat dengan oat bebas gluten bersertifikat yang telah diproses di fasilitas yang bebas dari gandum dan makanan mengandung gluten lainnya.
Beberapa resep muesli bebas gluten termasuk sebagian kecil gandum, menggunakan buah-buahan, kacang-kacangan, dan biji-bijian, serta krim atau susu segar, untuk memberikan lebih banyak makanan. Dengan jenis muesli ini, dimungkinkan bagi individu dengan toleransi gluten yang lebih tinggi untuk mengkonsumsinya tanpa mengalami efek negatif. Muesli bebas gluten yang dibuat sebelumnya dan dikemas sebelumnya harus diberi label bebas gluten dan disertifikasi sebelum siapa pun dengan tingkat intoleransi gluten atau penyakit celiac yang tinggi dapat memakannya. Lebih sering daripada tidak, muesli bebas gluten juga akan mengandung buah-buahan kering untuk menambahkan lebih banyak ke piring dan mengurangi ketergantungan pada proporsi gandum yang tinggi.
Muesli bebas gluten dapat dibuat dengan mudah tanpa oat sama sekali. Menir soba, serta beras merah, dapat digunakan sebagai pengganti gandum di sebagian besar resep muesli. Bahan-bahan ini harus dimasak untuk dikonsumsi, namun merupakan alternatif bebas gluten alami yang biasanya tidak diproses dengan gandum. Alternatif lain untuk gandum termasuk biji rami yang direndam dan digiling dan quinoa yang direndam dan dimasak. Bukan hal yang aneh bagi muesli versi bebas gluten untuk memasukkan alternatif ini untuk gandum, karena mengurangi risiko mengonsumsi gluten dalam jumlah sedikit.