Masa inkubasi klamidia adalah sekitar satu hingga tiga minggu pada kebanyakan pasien, meskipun pada beberapa pasien, dapat memakan waktu hingga enam minggu. Orang yang dites untuk infeksi menular seksual seperti klamidia harus tahu bahwa mungkin saja terinfeksi tanpa gejala; dalam kasus klamidia, antara 50 dan 80% orang dengan infeksi tidak memiliki gejala yang nyata, meskipun mereka dapat menularkannya kepada orang lain. Dites secara teratur untuk infeksi menular seksual dan menggunakan praktik seks yang lebih aman dianjurkan untuk orang yang aktif secara seksual.
Infeksi klamidia disebabkan oleh bakteri yang menyukai lingkungan alat kelamin yang hangat dan lembab. Hal ini dapat ditularkan melalui berbagai jenis kontak seksual, termasuk menggosok alat kelamin dan hubungan seksual penetrasi. Pada pria, gejala klamidia dapat berupa nyeri saat buang air kecil, keluarnya cairan dari penis, dan nyeri pada testis. Wanita dapat mengalami keluarnya cairan dari vagina, serta nyeri panggul. Strain klamidia yang berbeda juga dapat muncul di mata dan persendian, dan masa inkubasi untuk strain ini juga sekitar satu hingga tiga minggu.
Masa inkubasi klamidia tergantung pada sejumlah faktor, termasuk jumlah bakteri yang ditularkan selama kontak, di mana bakteri itu berakhir, dan tingkat kesehatan dan kebersihan pasien secara umum. Pada beberapa pasien, penyakit dapat menjadi jelas dalam waktu satu minggu, sementara pada pasien lain, mungkin membutuhkan waktu lebih lama, dan gejala mungkin tidak muncul pada akhir masa inkubasi klamidia bahkan ketika pasien mengalami infeksi. Jika orang tidak didiagnosis dan diobati, klamidia dapat menyebabkan komplikasi seperti infertilitas, serta penyakit radang panggul pada wanita.
Masa inkubasi infeksi menular seksual bervariasi, tergantung pada organisme yang terlibat. Orang yang dites untuk infeksi harus memperhatikan periode jendela untuk kondisi yang berbeda dan harus menyadari bahwa hasil tes negatif tidak berarti mereka tidak terinfeksi. Negatif palsu memang terjadi dan dalam beberapa kasus, ketika orang terinfeksi dan infeksi masih dalam masa inkubasi, mungkin tidak ada tanda-tandanya. Orang yang tidak melakukan aktivitas seksual selama enam bulan atau lebih kemungkinan besar akan menerima hasil yang valid pada tes untuk infeksi menular seksual.
Orang yang khawatir tentang masa inkubasi klamidia karena mereka yakin telah terpapar bakteri dapat menerima tes setelah tiga minggu, dan mungkin ingin menguji lagi setelah enam minggu untuk memastikan. Rekomendasi frekuensi tes IMS bervariasi tergantung pada keadaan. Orang-orang yang berisiko tinggi, seperti pekerja seks dan orang-orang dengan banyak pasangan, harus diuji lebih sering, sementara orang-orang dengan risiko rendah umumnya membutuhkan tes yang jarang.