Antigen peptida adalah penggunaan peptida untuk memicu sistem kekebalan hewan untuk mengembangkan antibodi terhadap peptida itu. Peptida adalah rangkaian pendek asam amino; rantai yang lebih panjang disebut protein. Antigen peptida dapat digunakan sebagai bagian dari pengembangan vaksin.
Peptida adalah molekul organik yang terdiri dari nitrogen, oksigen, karbon, hidrogen, dan biasanya belerang. Mereka adalah rantai asam amino dan dihubungkan oleh ikatan peptida. Ikatan peptida adalah ikatan gugus NH2 dan COOH dari dua asam amino yang berdekatan satu sama lain.
Antigen adalah molekul yang mengikat antibodi dan menghasilkan respons imun, reaksi tubuh terhadap molekul yang tampak asing. Tidak semua jenis molekul mampu dikenali oleh sistem imun. Protein, peptida, dan rantai gula dapat bertindak sebagai antigen.
Ada juga antigen manusia. Ini termasuk protein yang ada di permukaan sel tumor. Antigen tersebut juga dapat hadir dalam darah. Ini adalah dasar di balik pengujian antigen spesifik prostat, yang biasanya digunakan untuk menyaring kanker prostat. Beberapa antigen sengaja diperkenalkan untuk bertindak sebagai vaksin dan menghasilkan respon imun.
Antibodi adalah protein dalam darah yang melawan antigen tertentu. Hanya beberapa bagian dari molekul yang dikenali oleh antibodi. Ujung antibodi mengandung paratope yang mengenali struktur kompleks antigen. Wilayah antibodi ini bertanggung jawab atas keragaman besar antibodi yang ada dalam suatu organisme. Satu individu dapat memiliki jutaan antibodi yang berbeda.
Seringkali, antigen peptida digunakan karena merupakan bagian dari protein yang lebih besar, yang mungkin belum dimurnikan. Saat menggunakan antigen peptida untuk membuat antibodi, penting bagi peneliti untuk menggunakan bagian antigenik dari peptida. Spesialis antigen dapat membantu dengan desain antigen untuk memaksimalkan kemungkinan bahwa peptida yang digunakan sebagai antigen akan menghasilkan antibodi. Jauh lebih mudah untuk memprediksi epitop mana yang terpapar jika seseorang memiliki pengetahuan tentang struktur tiga dimensi senyawa.
Dalam kebanyakan kasus, tidak ada pengetahuan tentang keseluruhan struktur peptida, meskipun perangkat lunak prediktif dapat menganalisis bagian peptida mana yang mungkin bersifat antigenik. Peptida yang paling mungkin untuk menemukan antibodi adalah yang ada di permukaan sel. Mereka cenderung hidrofilik – larut dalam air. Fleksibilitas juga merupakan kriteria penting bagi antigen peptida untuk bereaksi dengan epitop.
Setelah antigen peptida yang cocok telah diidentifikasi, peptida sintetis dibuat. Ini kemudian dapat digunakan dalam imunisasi. Itu disuntikkan ke hewan untuk menghasilkan respon imun. Setelah antibodi diisolasi, mereka dianalisis untuk memastikan bahwa organisme tersebut telah memasang respons imun yang efektif.
Salah satu cara umum pengujian untuk melihat apakah antibodi spesifik untuk protein yang diinginkan adalah dengan melakukan Western Blot. Ini melibatkan pemisahan protein yang mengandung peptida pada gel menggunakan arus listrik. Ini disebut elektroforesis. Kemudian protein ditransfer ke membran dan diperiksa dengan antibodi.
Jika terdapat antibodi yang spesifik untuk protein tersebut, maka antibodi tersebut akan berikatan dengan protein pada membran. Membran dicuci dan kemudian diobati dengan antibodi sekunder. Jika antibodi dikembangkan pada tikus, misalnya, antibodi sekunder akan menjadi antibodi anti-tikus. Antibodi ini direkayasa untuk menghasilkan warna atau pendaran sehingga peneliti dapat melihat di mana antibodi asli telah terikat.