Anatomi tumbuhan adalah ilmu yang mempelajari tentang struktur fisik tumbuhan. Ia juga dikenal sebagai fitoanatomi, dengan praktisi disiplin ilmu ini dikenal sebagai ahli fitoanatomi. Seperti halnya anatomi hewan, tujuannya adalah untuk mempelajari lebih lanjut tentang bagaimana organisme disatukan dan cara kerjanya, dengan informasi ini digunakan untuk memperoleh pengetahuan yang lebih dalam tentang cara merawat tanaman dan cara mengatasi penyakit yang menyerangnya. Ahli fitoanatomi bekerja di sejumlah tempat, termasuk museum sejarah alam, arboretum, dan laboratorium yang mengembangkan tanaman baru untuk pertanian dan lansekap.
Ahli fitoanatomi mempelajari struktur tumbuhan secara keseluruhan dan membedahnya untuk mempelajari bagian-bagian komponennya. Ini juga dapat terjadi pada tingkat mikroskopis, dengan ahli anatomi memeriksa sel tumbuhan untuk mempelajari lebih lanjut tentang fungsinya, dan untuk membedakan berbagai jenis sel tumbuhan. Para ahli anatomi tumbuhan juga tertarik pada perkembangan tumbuhan, dari tahap awal sebagai biji melalui kedewasaannya hingga dewasa.
Dengan membedah dan mempelajari tumbuhan, peneliti dapat mempelajari perbedaan antara berbagai tumbuhan, yang merupakan bagian penting dari taksonomi tumbuhan. Dua tanaman mungkin terlihat sangat mirip di permukaan, misalnya, tetapi menjadi sangat berbeda ketika mereka dibedah dan dilihat di bawah mikroskop. Perbedaan tersebut dapat digunakan untuk menggambarkan dan mengkategorikan tumbuhan sehingga dapat ditempatkan dalam suatu sistem taksonomi. Anatomi tanaman juga dapat melibatkan mempelajari tanaman yang baru ditemukan dengan cermat untuk memastikan bahwa mereka unik dan untuk mengumpulkan data tentang mereka yang dapat digunakan untuk mengkategorikannya.
Semakin banyak orang memisahkan anatomi dan morfologi tumbuhan, dengan anatomi berkaitan dengan struktur internal tumbuhan, sedangkan morfologi melibatkan penampilan luar tumbuhan. Ada beberapa tumpang tindih antara bidang, namun. Bunga, misalnya, dapat diperiksa oleh ahli morfologi dan ahli anatomi, dengan ketertarikan pada struktur luar dan dalam bunga untuk mempelajari lebih lanjut tentangnya.
Orang yang bekerja sebagai ahli anatomi tumbuhan biasanya mengambil mata kuliah botani, biologi, dan topik terkait. Mereka dapat memilih untuk fokus pada jenis tanaman tertentu, seperti tanaman tropis, tanaman pangan, dan sebagainya, atau mereka dapat bekerja sebagai ahli anatomi umum di fasilitas seperti museum sejarah alam, membuat katalog akuisisi baru dan mengelola koleksi yang ada sehingga dapat dengan mudah dinavigasi dan digunakan sebagai sumber daya oleh pengunjung. Mereka juga dapat bekerja di tempat-tempat seperti laboratorium penelitian farmasi, mempelajari tanaman dengan khasiat obat.