Progesteron dan siklus menstruasi berkaitan erat karena menstruasi tidak dapat terjadi tanpa hormon ini. Progesteron bekerja dengan estrogen untuk menebalkan lapisan rahim, dan penurunan tiba-tiba progesteron menyebabkannya meluruh selama periode menstruasi jika kehamilan tidak terjadi. Hormon ini juga penting ketika kehamilan benar-benar terjadi, karena kadar progesteron yang tinggi memastikan perkembangan janin yang tepat. Selain itu, ketidakseimbangan antara progesteron dan estrogen dapat menyebabkan sindrom pramenstruasi (PMS). Beberapa wanita menggunakan hubungan antara progesteron dan siklus menstruasi untuk keuntungan mereka, karena hormon ini dapat mencegah dan meningkatkan kehamilan ketika jumlah yang berbeda hadir.
Selama fase folikular menstruasi, kadar progesteron dan estrogen cukup rendah, tetapi mereka meningkat setelahnya, estrogen selama fase ovulasi dan progesteron selama fase luteal. Saat sel telur baru matang di folikel, progesteron dan estrogen membantu menebalkan lapisan rahim jika terjadi kehamilan, sehingga embrio dapat berimplantasi dengan baik. Selain itu, tingkat progesteron tetap tinggi untuk memungkinkan janin berkembang dengan baik dan membiarkan darah beredar di dalam rahim. Pekerjaan lain dari hormon ini selama kehamilan adalah membuat sumbat lendir yang melindungi janin dari bakteri yang masuk ke dalam rahim. Kekurangan hormon ini dapat menyebabkan keguguran, itulah sebabnya progesteron dan siklus menstruasi sama-sama penting bagi wanita yang ingin melahirkan bayi sampai cukup bulan.
Kadar progesteron meningkat setelah ovulasi dan jika kehamilan tidak terjadi, kadar progesteron turun tiba-tiba, menyebabkan lapisan rahim luruh selama menstruasi. Namun, sebelum penurunan progesteron, banyak wanita menderita PMS, yang merupakan akibat dari ketidakseimbangan hormon. Tingkat progesteron sering melonjak pada titik ini, yang dapat membuat wanita merasa lebih lapar dari biasanya. Banyak wanita juga mengeluh kembung sebelum menstruasi sebagai akibat dari kecenderungan progesteron untuk membuat ginjal menyimpan air dan garam. Selain itu, wanita sering melihat payudara yang lebih besar dan kencang karena jaringan membesar akibat hormon ini, yang merupakan cara lain progesteron bekerja sama dengan siklus menstruasi bahkan setelah kehamilan belum terjadi.
Beberapa wanita memanfaatkan hubungan antara progesteron dan siklus menstruasi dengan menambahkan lebih banyak hormon wanita ini ke tubuh mereka untuk mencapai berbagai hasil. Misalnya, beberapa wanita dapat membantu mencegah keguguran akibat kadar progesteron yang rendah dengan meminum pil, suntikan, atau supositoria yang mengandung hormon ini. Wanita lain yang mencoba mencegah kehamilan menggunakan pil KB yang hanya mengandung progesteron, yang dapat mengentalkan lendir serviks sehingga sulit bagi sperma untuk mencapai serviks. Ini juga dapat mengencerkan lapisan rahim, karena peningkatan hormon ini diikuti dengan penurunan tiba-tiba membuat lapisan tidak menjadi terlalu tebal. Pil KB yang hanya mengandung progesteron memiliki efek samping yang lebih sedikit daripada pil kombinasi yang juga mengandung estrogen, membuatnya menarik bagi beberapa wanita. Wanita harus menentukan pengobatan terbaik berdasarkan saran dan pengawasan dokter mereka.