Karena kolagen, struktur pendukung protein untuk rambut, bergantung pada asam amino lisin, kekurangan lisin dan rambut rontok berkorelasi positif. Penelitian menunjukkan bahwa mereka yang mengalami alopecia, kerusakan rambut, dan penurunan pertumbuhan rambut sering kali menderita kekurangan lisin. Hubungan lain antara lisin dan kebotakan adalah bahwa lisin bisa efektif dalam memblokir enzim yang bertanggung jawab atas kebotakan.
Lisin berfungsi sebagai bahan pembangun kolagen dalam sel rambut secara khusus karena membantu penyerapan kalsium dalam tubuh; Kalsium merupakan salah satu faktor utama yang dibutuhkan untuk pembentukan kolagen pada kuku, rambut, dan kulit. Kadar lisin yang rendah dalam tubuh seringkali merupakan akibat dari nutrisi yang tidak seimbang. Porsi protein harian dari sumber seperti daging, telur, ikan atau kacang-kacangan umumnya cukup untuk mencegah tingkat lisin dan rambut rontok yang rendah. Orang yang paling berisiko menderita insufisiensi lisin adalah vegan yang tidak cukup mengonsumsi kacang-kacangan dan atlet yang fisik berototnya membutuhkan kebutuhan protein yang lebih tinggi.
Kemampuan lisin untuk memblokir enzim 5-alpha reductase tipe 2 membantu dalam mencegah kebotakan, terutama kebotakan berpola pria yang ditandai dengan kerontokan rambut di bagian depan dan atas kepala. Enzim ini dikenal untuk mengubah testosteron dalam tubuh menjadi dihidrotestosteron (DHT), yang menyebabkan folikel rambut berhenti memproduksi rambut. Namun, dengan adanya lisin, daya konversi enzim dihambat. Sementara korelasi antara lisin dan rambut rontok terkait dengan DHT mempengaruhi terutama pria, wanita masih bisa mendapatkan keuntungan dari lisin di luar kekuatan pembentukan kolagennya. Penelitian menunjukkan bahwa sementara suplementasi zat besi sering diresepkan untuk wanita dengan rambut rontok, lisin biasanya diresepkan secara bersamaan karena meningkatkan kemampuan zat besi untuk membalikkan alopecia.
Simpanan lisin dalam tubuh seringkali dapat diisi ulang melalui suplementasi. Trichologists menyarankan bahwa 500 mg sampai 800 mg sehari mungkin cukup untuk menghentikan atau membalikkan kerontokan rambut terkait dengan kelangkaan lisin. Manfaat menggunakan suplemen untuk mengobati kekurangan lisin dan rambut rontok termasuk kenyamanan dan berbagai bentuk aplikasi dan konsumsi. Banyak perusahaan memproduksi krim berbasis lisin yang dapat dioleskan ke kulit kepala dan rambut; ada juga suplemen lisin cair yang disebut-sebut karena penyerapannya yang cepat. Kapsul dan tablet adalah pilihan alternatif.
Sementara lisin alami yang diperoleh dari diet seimbang aman, suplementasi lisin tinggi untuk jangka waktu yang lama seringkali dapat menyebabkan batu empedu. Efek samping lain dari suplementasi lisin termasuk kolesterol yang lebih tinggi dan kerusakan ginjal atau gagal ginjal total. Orang yang sudah terkena gangguan ginjal atau hati disarankan oleh dokter untuk menghindari suplementasi lisin, seperti halnya wanita hamil.