Hubungan antara estrogen dan jerawat agak rumit karena fluktuasi hormon pada siklus menstruasi wanita normal dapat menyebabkan jerawat pada waktu yang berbeda. Kadar estrogen yang rendah dan kadar hormon androgen yang lebih tinggi secara proporsional umumnya menyebabkan jerawat kistik terkait estrogen. Ketidakseimbangan hormon yang menurunkan kadar estrogen atau meningkatkan kadar androgen akan meningkatkan kemungkinan pembentukan jerawat karena meningkatkan jumlah minyak yang diproduksi oleh kelenjar sebaceous di bawah permukaan kulit. Pil KB dapat meringankan beberapa jerawat parah, karena pil tersebut secara hati-hati menjaga kadar estrogen dan androgen dalam aliran darah.
Androgen adalah penyebab utama jerawat yang berhubungan dengan hormon pada banyak wanita. Hormon-hormon inilah yang merangsang kelenjar sebaceous untuk menghasilkan zat berminyak yang dikenal sebagai sebum. Terlalu banyak zat ini seringkali dapat tersangkut di pori-pori, menyediakan tempat berkembang biak bagi bakteri kulit umum yang berkembang biak di bawah permukaan kulit. Setelah bakteri berkembang biak, mereka sering dapat menyebabkan peradangan, yang menyebabkan jerawat kistik. Estrogen mampu membatalkan atau menutupi efek androgen pada tubuh.
Tingginya kadar estrogen dan jerawat terjadi pada waktu yang berlawanan dalam siklus menstruasi yang khas. Selama paruh pertama siklus, sebelum ovulasi terjadi, kadar estrogen meningkat secara bertahap. Ini tidak hanya mengurangi efek androgen dalam tubuh, tetapi juga mengurangi terjadinya jerawat. Tubuh mencapai puncak estrogennya tepat sebelum ovulasi, setelah itu kadar estrogen berangsur-angsur berkurang. Jerawat biasanya meningkat setelah ovulasi dalam waktu yang dikenal sebagai fase luteal, dan menjadi yang terburuk sebelum menstruasi.
Selama fase luteal dari siklus, progesteron, hormon yang memiliki sifat seperti estrogen dan seperti androgen, secara bertahap meningkat. Fluktuasi progesteron dapat meningkatkan tingkat kembung dan cairan, yang pada gilirannya menekan pori-pori di wajah. Pengurangan ukuran pori ini sering memperburuk gejala jerawat karena semakin membatasi kemampuan tubuh untuk membersihkan kelebihan minyak.
Pil KB memberikan kadar estrogen dan progesteron yang dikontrol dengan hati-hati dalam aliran darah. Dengan menjaga tingkat estrogen yang konsisten sepanjang bulan, pil dapat mengurangi efek androgen selama fase luteal selain mengurangi fluktuasi hormon secara umum. Ini pada akhirnya mengarah pada pengurangan jerawat bagi banyak wanita, terutama mereka yang mengalami ketidakseimbangan hormon yang parah sebelum memulai perawatan.