Dalam tubuh manusia, fisiologi sistem reproduksi antara pria dan wanita berbeda. Pada kedua jenis kelamin, fisiologi sistem reproduksi terdiri dari alat kelamin eksternal dan internal dan gonad, tetapi apa dan di mana organ-organ ini berbeda secara signifikan. Alat kelamin adalah organ dan bagian tubuh yang diperlukan agar reproduksi dapat terjadi. Gonad adalah organ yang bertanggung jawab untuk memproduksi sel benih reproduksi, atau gamet.
Fisiologi sistem reproduksi pada pria meliputi beberapa bagian tubuh dan organ. Alat kelamin luar terdiri dari penis dan skrotum. Genitalia interna sebagian besar ditemukan dalam bagian tubuh laki-laki dan termasuk testis, epididimis, vas deferens, vesikula seminalis, uretra dan prostat. Gamet jantan, atau sperma, diproduksi di dalam testis, yang merupakan gonad jantan.
Sementara sebagian besar organ reproduksi laki-laki ditemukan di dalam alat kelamin luar, hal ini tidak terjadi pada perempuan. Fisiologi sistem reproduksi untuk wanita sebagian besar ditemukan di perut bagian bawah. Genitalia eksterna terdiri dari labia dan klitoris, yang sangat dibutuhkan untuk rangsangan seksual. Sebagian besar organ internal dan termasuk vagina, leher rahim, rahim, saluran tuba dan ovarium. Ova, atau telur, diproduksi di dalam ovarium wanita.
Tidak hanya fisiologi sistem reproduksi yang berbeda antara pria dan wanita, begitu juga proses di mana gamet diproduksi dan dikirim selama reproduksi. Spermatogenesis adalah proses yang menghasilkan sperma di dalam tubulus seminiferus testis, yang berlanjut sepanjang hidup seorang pria. Setelah sel sperma diproduksi, mereka matang dan disimpan di dalam epididimis sebagai persiapan untuk pembuahan. Sebelum ejakulasi, sel sperma dicampur dengan cairan mani dari kelenjar prostat dan vesikula seminalis untuk membuat air mani. Selama ejakulasi, air mani meninggalkan penis melalui uretra.
Di dalam tubuh wanita, semua sel telur sudah ada sejak lahir dan tidak ada sel telur lagi yang akan diproduksi sepanjang hidup wanita tersebut. Mulai saat pubertas, telur mulai matang di dalam ovarium, dan setiap bulan, satu sel telur matang dilepaskan dari salah satu ovarium. Ini bergantian di antara mereka berdua. Kemudian bergerak di sepanjang saluran tuba ke rahim. Jika pembuahan oleh sel sperma tidak terjadi, sel telur dan lapisan rahim dikeluarkan melalui leher rahim dan vagina selama menstruasi.