Kebanyakan kit isolasi asam ribonukleat (RNA) dapat mengisolasi RNA berkualitas tinggi dari berbagai jaringan dan jenis organisme, termasuk tumbuhan, hewan, dan virus. RNA mitokondria dan ribosom – mRNA dan rRNA, masing-masing – mungkin memerlukan kit isolasi RNA khusus untuk untaian kecil RNA. Faktor lain yang mungkin berbeda di antara berbagai kit isolasi adalah jumlah sampel yang dapat diproses setiap kit dan waktu yang diperlukan untuk memproses sampel sepenuhnya.
Jenis kit isolasi RNA yang paling umum dapat digunakan untuk berbagai macam aplikasi, terlepas dari mana RNA berasal. Sel dan jaringan mamalia adalah salah satu sumber yang paling dominan digunakan untuk isolasi dan pemurnian RNA. Sel tumbuhan dan virus juga digunakan dalam eksperimen biologi molekuler yang memerlukan penggunaan kit isolasi RNA.
Setelah sampel jaringan atau darah dikumpulkan, sampel tersebut harus disiapkan untuk isolasi RNA selama proses kritis yang dikenal sebagai degradasi, pemisahan, atau gangguan seluler. Jika materi seluler tidak selesai terganggu, proses isolasi RNA akan menghasilkan lebih sedikit RNA. Kit isolasi RNA terbaik mencakup bahan dan persediaan untuk degradasi seluler sebelum isolasi dan pemurnian RNA setelah isolasi.
Dalam kasus khusus di mana percobaan memerlukan mRNA atau rRNA, kit isolasi RNA khusus tersedia untuk untai RNA yang sangat kecil. Bahan dan perlengkapan yang termasuk dalam kit tersebut mungkin berbeda dalam hal jumlah dan ukuran. Kit isolasi RNA ini kurang umum dibandingkan kit RNA multiguna, dan mungkin ada perbedaan biaya yang cukup besar.
Banyak kit isolasi RNA umum dirancang untuk digunakan dengan semua jenis jaringan dan sel dan dapat menyelesaikan reaksi dalam waktu sekitar 20 menit. Waktu yang diperlukan untuk degradasi sel lengkap dapat bervariasi tergantung di mana dalam organisme sel-sel itu dikumpulkan. Di luar langkah degradasi seluler, proses isolasi RNA dan pemurnian selanjutnya relatif standar dalam hal prosedur dan waktu.
Fitur lain yang dapat spesifik untuk kit tertentu adalah jumlah sampel yang dibutuhkan untuk memproses reaksi. Sementara beberapa kit isolasi mungkin memerlukan volume sampel yang relatif besar, kit lain mungkin bekerja dengan baik dengan volume yang lebih kecil. Perbedaan ini dapat menjadi keuntungan jika volume sampel merupakan faktor pembatas.
Beberapa produsen kit isolasi RNA memiliki grafik perbandingan yang tersedia di Internet. Bagan ini dapat digunakan untuk melihat perbedaan antara berbagai kit yang mereka hasilkan. Perbedaannya dapat mencakup jenis aplikasi khusus, bahan kimia, dan volume sampel yang diperlukan.