Anatomi sistem reproduksi mencakup organ, jaringan, dan pembuluh yang berpartisipasi dalam proses reproduksi, atau generasi satu atau lebih keturunan dari induk jantan dan betina. Berbeda dengan sistem lain dari tubuh manusia, anatomi sistem reproduksi berbeda secara signifikan pada pria dan wanita. Pada wanita, organ utama meliputi vagina, rahim, dan ovarium, sedangkan pada pria alat reproduksi utama adalah penis, skrotum, dan testis. Saluran tuba dan leher rahim menghubungkan organ-organ ini dalam sistem reproduksi wanita, sedangkan pada pria, pembuluh darah termasuk epididimis dan vas deferens. Pembahasan tentang anatomi sistem reproduksi juga harus mencakup unit terkecilnya, yaitu sel sperma pada pria dan ovum atau sel telur pada wanita.
Pada pria dan wanita, anatomi sistem reproduksi dapat dibagi menjadi organ eksternal dan internal. Organ eksternal wanita sering disebut sebagai vagina. Namun, organ ini secara teknis adalah saluran internal yang mengalirkan sperma pria ke dalam rahim.
Alat kelamin luar wanita termasuk labia mayor pelindung, lipatan besar yang membungkus organ luar yang tersisa: labia minora, klitoris, dan kelenjar Bartholin. Labia minora adalah lipatan kecil yang melindungi lubang vagina serta lubang uretra, atau saluran kemih. Klitoris adalah organ kecil yang berisi saraf di depan lubang vagina yang homolog dengan penis pria. Wanita juga memiliki kelenjar Bartholin, yang melepaskan sekresi yang memberikan pelumasan awal untuk penis saat masuk ke vagina.
Organ luar sistem reproduksi pria meliputi penis, testis, dan skrotum. Penis adalah organ yang memungkinkan sperma mencapai sel telur wanita selama hubungan seksual, atau penetrasi vagina. Padat dengan pembuluh darah, itu menjadi tegak selama gairah karena aliran darah ke daerah tersebut, memungkinkan untuk menembus vagina wanita. Di belakang penis adalah skrotum, kantung eksternal yang berisi dan melindungi testis berpasangan. Testis atau testis ini adalah organ yang menghasilkan sperma, sel reproduksi pria.
Anatomi sistem reproduksi juga harus mencakup organ internal reproduksi. Pada wanita, ini adalah vagina, rahim, dan ovarium. Vagina adalah saluran yang dapat diperluas, hanya beberapa inci dalamnya, yang mengarah ke rahim dan tempat bayi lewat saat melahirkan. Di bagian belakang vagina adalah leher rahim, sebuah lubang di mana sperma melewati perjalanan ke rahim. Rahim adalah ruang di mana janin tumbuh selama kehamilan, dan juga dapat berkembang banyak.
Di kedua sisi rahim bagian atas, saluran tuba mengarah ke ovarium, organ seks wanita. Organ ini menghasilkan sel telur atau ovum yang dikeluarkan setiap bulan untuk dibuahi oleh sperma pria. Jika ini tidak terjadi, mereka dikeluarkan dari tubuh bersama dengan lapisan rahim, di mana sel telur yang telah dibuahi akan tertanam pada saat pembuahan, dalam bentuk menstruasi.
Anatomi internal sistem reproduksi pria meliputi uretra, vas deferens, dan epididimis. Dimulai dengan lubang di ujung penis, uretra adalah pembuluh internal yang mengalirkan air mani, cairan yang mengandung sperma, dan urin keluar dari tubuh. Ini mengarah ke vas deferens, tabung yang membawa air mani ke uretra.
Epididimis adalah unit penyimpanan testis. Itu terletak di belakang setiap testis dan merupakan tabung yang menampung sel-sel sperma yang diproduksi oleh testis sampai mereka cukup dewasa untuk dapat membuahi sel telur wanita. Selama gairah, sel-sel ini dilepaskan dari epididimis ke dalam vas deferens, di mana mereka bercampur dengan cairan mani untuk membentuk air mani, yang akan dilepaskan ke dalam vagina wanita saat ejakulasi.