Det bästa botemedlet mot bakteriell vaginos är vanligtvis ett receptbelagt läkemedel. Antibiotika, antingen intagna i oral form eller införda i slidan, är vanligtvis effektiva för att bli av med de bakterier som är ansvariga för bakteriell vaginos. För de flesta kvinnor är orala antibiotika den bästa behandlingen för ett fall av bakteriell vaginos, eftersom de som förs in i slidan ofta är lite mindre effektiva. Ibland kan en kvinna också överväga en huskur mot bakteriell vaginos, men huskurer är vanligtvis inte tillförlitliga för att behandla just denna bakterieinfektion.
I de flesta fall är det bästa botemedlet mot ett fall av bakteriell vaginos ett antibiotikum som kallas metronidazol, som ofta säljs under varumärket Flagyl®. Metronidazol ordineras vanligtvis i pillerform, men kan också administreras genom slidan. Gelformen som förs in i slidan för behandling av bakteriell vaginos kallas Metrogel®. Kvinnor kan också använda en gel som kallas clindamycin som ett alternativ till Metrogel®. Det är också värt att notera att vissa fall av bakteriell vaginos går över av sig själv.
I allmänhet är oral metronidazol mer effektiv för behandling av bakteriell vaginos än vaginala applikationer. I vissa fall kan dock en kvinna föredra den vaginalt administrerade medicinen trots att den är lite mindre effektiv än den orala medicinen. Detta beror på det faktum att vissa personer har rapporterat obehagliga biverkningar när de tagit metronidazol. Biverkningar kan också uppstå med vaginalgelerna, men de är vanligtvis mindre och mindre benägna att utvecklas.
Även om metronidazol vanligtvis anses vara det bästa botemedlet mot bakteriell vaginos, finns det andra antibiotika som också kan visa sig effektiva. En av de alternativa behandlingarna för bakteriell vaginos kallas tinidazol. Även om det kanske inte är lika effektivt för att behandla bakteriell vaginos som metronidazol, anses det vara en pålitlig behandling. Det är också förknippat med färre biverkningar än metronidazol.
En kvinna kan också känna sig frestad att prova en huskur mot bakteriell vaginos. Vanligtvis misslyckas dock huskurer, och en kvinna kan fortfarande behöva medicinsk behandling efter att hon provat dem. Läkare brukar dock rekommendera behandling, eftersom bakterieinfektionen kan orsaka komplikationer. Till exempel kan bakteriell vaginos leda till missfall, för tidigt värkarbete och infektion i livmodern efter förlossningen. Obehandlad bakteriell vaginos kan också bidra till utvecklingen av bäckeninflammatorisk sjukdom, vilket kan leda till allvarlig sjukdom och permanent infertilitet.