Även om den korrekta strukturen för en forskningsartikel kan variera beroende på disciplin, består den i allmänhet av fyra huvuddelar: en introduktion, en kropp, en slutsats och en referenslista. Att veta hur man strukturerar delarna av en forskningsartikel kan hjälpa till att förenkla skrivprocessen. En introduktion bör presentera uppsatsens huvudargument, eller avhandling, och bör gå från allmän information till mer specifik information. Kroppen bör bestå av fristående stycken eller avsnitt som var och en försvarar avhandlingen på ett nytt sätt, och slutsatsen bör sammanfatta uppsatsen och i vissa fall föreslå var ytterligare forskning kan behövas. Slutligen bör referenser i allmänhet listas i alfabetisk ordning och bör formateras enligt konventionerna för den stil som används för resten av uppsatsen.
En av de viktigaste delarna av en forskningsartikel är inledningen, som förbereder läsaren för den information som följer på den genom att ange uppsatsens avhandling. Beroende på längden på uppsatsen och de krav som ställs av ens instruktör, kan inledningen bestå av ett enda stycke eller ett avsnitt med flera stycken. För att skapa en introduktion som flyter bra kan det vara användbart att gå från det allmänna till det specifika. Till exempel kan en student som skriver ett forskningsuppsats och argumenterar för att solenergi är den bästa formen av förnybar energi börja sin introduktion med några meningar som ger allmän bakgrundsinformation om förnybar energi, och sedan fortsätta med att framföra sitt eget argument.
Kroppsstycken är de delar av en forskningsartikel som presenterar bevis som backar upp författarens avhandling. Varje kroppsstycke bör vara en fristående enhet som tar upp en separat del av tidningens argument. Till exempel kan en artikel som argumenterar för solenergi innehålla ett stycke som förklarar att solen ger en pålitlig energikälla, en som säger att utrustning för att utnyttja solenergi kan vara relativt billig, och en som visar att solenergi kan vara lätt omvandlas till hushållsel. Huvudidén för varje stycke bör placeras i början av det stycket. Den idén bör sedan följas av några meningar som innehåller konkreta bevis som skribenten har samlat på sig under sin forskningsfas.
Slutsatsen tenderar att vara bland de kortaste delarna av en forskningsartikel, och kräver vanligtvis bara några få meningar. Vanligtvis bör en slutsats återge tidningens huvudargument och bör sammanfatta dess innehåll på ett mycket kortfattat sätt. Beroende på ens instruktörs preferenser kan den också behöva föreslå hur ytterligare forskning kan ta vid där uppsatsen slutar.
Slutligen avslutas de flesta forskningsartiklar med en lista över referenser som citerades i artikeln eller konsulterades medan författaren undersökte sitt ämne. I allmänhet måste denna lista presenteras i alfabetisk ordning, där varje post innehåller fullständig publikationsinformation för den källa som används. Eftersom de exakta formateringsreglerna för referenslistor kan variera kraftigt från en disciplin till en annan, är det viktigt att konsultera sin instruktör för att ta reda på hur varje bidrag bör struktureras.