Det finns tre sätt att blötlägga bönor innan de tillagas, oavsett om de ska tillagas ordentligt senare, för att ta bort oönskade ämnen och smuts från ytan eller båda. Den mest klassiska metoden som används för att blötlägga bönor är helt enkelt att placera bönorna i en skål eller panna gjord av ett icke-reaktivt material och täcka dem i kallt vatten, så att de kan dra i flera timmar eller över natten, tills de mjuknar. De andra två metoderna som används för att blötlägga bönor går ut på att koka bönorna kort i kokande vatten och sedan låta dem dra i det varma vattnet i en timme eller mer. Båda metoderna har varit kända för att fungera bra, även om åldern och typen av bönor kan drastiskt påverka mängden blötläggning och tillagningstid de kommer att behöva. Det är viktigt att tvätta bönorna noggrant efter att de har blötlagts och att koka dem i en färsk kastrull med vatten, eftersom blötläggningsvattnet kommer att vara fullt av partiklar av material som inte bör ätas och kan påverka smaken på de färdiga bönorna.
Det enklaste men mest tidskrävande sättet att blötlägga bönor är att täcka dem i kallt vatten och låta dem sitta så länge som behövs för att göra dem mjuka. Denna metod fungerar bra och har fördelen av att helt ta bort föreningar som fytinsyra, som kan förhindra mineralabsorption, och oligosackarider, som är sockerarter som inte smälts ordentligt och kan orsaka gaser. Den långsamma blötläggningen ger också bönorna en chans att absorbera vätskan gradvis, vilket förhindrar risken för att skalen spricker eller att bönorna exploderar. Dessutom kommer all typ av smuts eller andra rester som finns kvar på ytan från bearbetningen att tas bort och passera ut i vattnet. I vissa fall är det viktigt att förhindra att bönorna blötläggs för länge i varmt vatten när luften är väldigt varm, eftersom det finns en liten chans att bönorna kan börja jäsa eller gro.
En snabbare metod som kan användas för att blötlägga bönor innebär att man lägger bönorna i en kastrull och täcker dem i kallt vatten. Pannan värms sedan upp tills vattnet kokar, och bönorna får koka i några minuter. Efter kokning tas kastrullen av värmen och bönorna får dra i några timmar. Bönor som tillagas på det här sättet behöver inte ligga i blöt över natten utan kan ha en fastare konsistens när de tillagas. En liknande metod involverar samma process men använder en tryckkokare istället för en enkel gryta och trycket tillåts minska naturligt innan bönorna tas bort, vilket minskar den tid som bönorna behöver blötläggas.
Oavsett vilken metod som används för att blötlägga bönor, bör vattnet som användes kasseras när blötläggningen är klar. Allt material i och på bönorna kommer att finnas i vattnet och kan påverka smaken. Bönorna bör också tvättas efter blötläggning för att avlägsna material som vattnet kan ha lämnat på ytan. När det är dags att koka bönorna bör färskt kallt vatten användas i kokkärlet.