Det finns ett antal tekniker för att bekämpa fruktflugor i köket, inklusive metoder för att förhindra angrepp och för att snabbt få slut på dem. Det är viktigt att identifiera flugor noggrant innan man påbörjar en utrotningskampanj, eftersom tekniker som är effektiva för fruktflugor kanske inte fungerar med andra arter. Fruktflugor är små och tenderar att attraheras av frukt och söta saker som lämnas ute på disken. De tenderar också att vara vanligare på hösten.
För att förhindra angrepp av fruktflugor är det viktigt att ta bort källor till mat och vatten. Läckor och andra potentiella möjligheter för fukt bör åtgärdas. Detta kommer också att minska på myror och andra oönskade besökare. Om färsk frukt behöver lämnas ute och den inte kan förslutas i behållare, bör den förvaras i en skärmad behållare för att hålla flugorna ute. Avskärmning av öppna fönster rekommenderas också för att hålla fruktflugor och andra insekter borta från huset. Att hålla köket noggrant rent och noggrant skölja all återvinning, särskilt läskburkar och flaskor, kommer också att hjälpa. Detta eliminerar potentiella attraktioner, vilket gör ett kök mindre intressant för fruktflugor.
För personer som utvecklar problem med fruktflugor i köket kan flugpapper hjälpa till att fånga flugor för borttagning. Fällor är också användbara; en mycket enkel fälla kan göras genom att hälla några uns vinäger eller lägga en liten bit frukt i en burk och placera en papperstratt med en liten öppning nedåt över den. Flugorna kan komma in i tratten men har svårt att fly. När fällan är full kan fruktflugorna tas ut.
Insektsmedel är också ett alternativ, men det måste användas försiktigt. Kemiska sprayer kan vara farliga för barn och husdjur. Agnade flugfällor bör förvaras borta från mat och utom räckhåll för småbarn och djur för säkerhets skull, och de bör också tömmas omedelbart för att undvika en ansamling av döda flugor.
Avlopp är ibland riktade som en källa eller lockande medel för fruktflugor i köket. Vissa insekter häckar i avlopp, men vanligare är att organiskt material som fångas i avloppet lockar flugor, och folk tror att flugorna kommer från avloppen eftersom de ser dem sväva runt öppningarna. Ett enzymrengöringsmedel kan hällas i avloppet för att lösa upp kakad mat och låta den spolas. Att hälla bakpulver och vinäger i avloppet och följa med en sköljning med kokande vatten kan också vara effektivt.