Även om bipolär och schizofreni fortfarande för det mesta anses vara två distinkta psykiatriska sjukdomar, är de relaterade på många sätt. Båda sjukdomarna utvecklas vanligtvis i slutet av tonåren eller tidig vuxen ålder. De genetiska orsaksfaktorerna har visat sig vara mycket lika i de två hjärnsjukdomarna; båda störningarna förekommer ofta i samma familjer. Vissa människor får diagnosen symtom på båda sjukdomarna. Schizofreni och bipolär eller manodepressiv sjukdom delar också vanliga symtom och behandlingar.
Vissa mediciner som ordineras för både bipolär och schizofreni sänker nivåerna av proteinkinas C (PKC) i hjärnan. Höga nivåer av detta hjärnprotein tros öka svårighetsgraden av symtom som är relaterade till båda sjukdomarna som att höra eller se saker som inte finns där, ha rasande tankar och uppleva storslagna eller falska övertygelser om ens personliga kraft. I det som kallas den dysforiska stämningen vid schizofreni upplever schizofrena ofta svår irritabilitet, ångest och depression liknande vad bipolärer, eller manodepressiva, tenderar att ha i sina depressiva perioder. Om de inte behandlas är det extremt troligt att både bipolära och schizofrena missbrukar droger eller alkohol som ett sätt att ”självmedicinera”.
Den största skillnaden mellan symptomen på schizofreni och bipolär sjukdom är humöret. Bipolär sjukdom anses vara en sinnesstämning som kännetecknas av två extrema sinnesstämningar: manisk optimism och depressiv hopplöshet. De distinkta sinnesstämningarna är så svåra att de stör bipolärens dagliga liv; en humörstabilisator som litium ordineras ofta. Schizofreni har inte två separata perioder av humör, utan upplever ständigt olika grupper av symtom som kallas negativa och positiva; dessa kan kontrolleras med antipsykotiska läkemedel såsom Haldol. Negativa symtom är de svåraste att behandla med medicin; de visar sig som underfungerande, såsom brist på känslor, tal eller uttryck, medan positiva schizofrena symtom är överfungerande, såsom att höra röster eller tro på att ha övermänskliga krafter.
Det är möjligt för en person att ha båda sjukdomarna eller åtminstone överlappande symtom. En schizoaffektiv diagnos avser en person med schizofreni och en humörstörning som bipolär eller egentlig depression. En egentlig depressiv sjukdom skiljer sig från bipolär genom att den saknar den maniska fasen. Bipolär och schizofreni anses vara särskilt relaterade. Studier har visat att schizofreni gör en person mer mottaglig för att utveckla bipolär sjukdom.
Att ha familjemedlemmar med antingen schizofreni eller bipolär sjukdom ökar risken för att utveckla en eller båda sjukdomarna. En familj med en historia av en sjukdom har sannolikt den andra sjukdomen också. Bipolär och schizofreni har genetiska komponenter som är kopplade till båda hjärnsjukdomarna.