Organisationsstruktur är ett ramverk genom vilket de anställda i ett företag eller en organisation övervakas och uppgifter fördelas. Även om en sådan ordning har breda konsekvenser för det övergripande sättet på vilket en organisation uppnår sina mål, påverkar den också starkt ledningen av specifika projekt. Organisationsstrukturens roll i projektledning är viktig, eftersom övervaknings- och uppgiftsfördelningsstrukturerna i en organisation direkt påverkar förväntningarna, graden av självständighet och flexibilitet som tillåts för personer eller grupper som arbetar med vissa projekt. Organisationsstruktur kan också påverka hur olika grupper som arbetar tillsammans i ett projekt interagerar med varandra och hur begränsade projektresurser allokeras.
Många organisationer är strukturerade på ett strikt hierarkiskt sätt, vilket innebär att det finns en strikt definierad maktstruktur där överordnade fattar beslut som styr deras underordnades handlingar. En hierarkisk organisationsstruktur kommer i allmänhet att tvinga fram stabilitet och effektivitet i projektledning. Överordnade fattar de viktigaste besluten om ett projekts gång, tidslinjen och fördelningen av uppgifter och resurser, och deras underordnade utför uppgifterna med liten eller ingen självständighet. Denna typ av organisationsstruktur kan leda till snabba projektavslut och effektiv resursanvändning.
Andra organisatoriska strukturer, även om de fortfarande är generellt hierarkiska överlag, tillåter en stor del av självständighet i projektledning. Syftet med denna form av organisationsstruktur inom projektledning är att ge större möjlighet till kreativitet och innovation. Projekt slutförs ofta av små, fristående ”team” som har sina egna organisationsstrukturer. Medan team eller autonoma individer förväntas rapportera sina framsteg till överordnade, behöver de ofta inte följa en strikt tidslinje och kan till stor del själva bestämma det bästa sättet att slutföra projektet. Denna typ av struktur resulterar ofta i långsammare projektavslut och mindre effektiv resursanvändning, men den bidrar till innovationer som avsevärt kan öka värdet av ett givet projekt.
Organisationsstruktur kan påverka projektledning på några andra sätt. I vissa fall inkluderar till exempel en organisations struktur grundliga utbildningsprogram som kan förbättra chefers och anställdas förmåga att genomföra vissa typer av projekt. Vissa strukturer effektiviserar projektledningsprojektet och resulterar i effektiv resursanvändning och kompetenta arbetare. Andra, särskilt alltför komplexa strukturer, kan helt enkelt komplicera projektledning och resultera i ogenomträngliga byråkratiska hinder för projektledning och slutförande.