Vävnadsmikroarrayer, även kallade TMA, är urval av vävnadskärnor framställda i ett paraffinblock och arrangerade på ett exakt sätt. Histologiska sektioner av arrayen kan skäras från paraffinblocket, vilket resulterar i tunna skivor av den paraffinberedda vävnadsarrayen som kan placeras på ett vanligt objektglas. Vävnadsmikroarrayer används för att utföra en mängd olika tester på många vävnadsprover som finns på ett enda objektglas, vilket möjliggör stor hastighet och precision i experiment. Forskare, till exempel, använder ofta vävnadsmikroarrayer för att bestämma genuttryck i normala och i patologiska vävnader för att använda genetik för att diagnostisera olika sjukdomar.
Många olika laboratorier, mestadels inom biologisk forskning och hälsoforskning, använder vävnadsmikroarrayer för att förbättra effektiviteten och precisionen med vilken de kan utföra olika experiment på vävnadsprover. Immunhistokemi är till exempel en process där fluorescerande medel fästs till antikroppar som exponeras för vävnadsprover på en mikroarray. Antikropparna binder till specifika antigener på vävnadsprover och forskare kan identifiera denna bindning på grund av de fluorescerande medlen. Vissa specifika antikroppar binder till specifika antigener, så bindningsnivåer kan ge en hel del information om antigenerna som finns i ett givet vävnadsprov. Olika antigener kan finnas på normala eller patologiska celler; att förstå skillnaden kan möjliggöra korrekt sjukdomsdiagnos och kan till och med ge information som kan användas för att hitta botemedel mot olika sjukdomar.
En liknande teknik som vanligtvis används på vävnadsmikroarrayer kallas Fluorescent in situ hybridization, eller FISH. I FISH binder fluorescerande sonder till vissa delar av kromosomerna och kan användas för att hitta information om en individs genetiska sammansättning. Denna metod kan till exempel användas för att identifiera genetiska markörer för olika sjukdomar. Både FISH och immunhistokemiska metoder används ofta för att diagnostisera och identifiera behandlingar för cancer.
Vävnadsprover kan vara svåra att få i betydande mängder, och vävnadsmikroarrayer tenderar att ta ganska lång tid att förbereda, så forskare måste se till att deras prover förblir intakta och att arrayen är korrekt förberedd. Vävnad, till exempel, måste snabbt bearbetas i paraffin för att förhindra förfall. Vissa forskare väljer att köpa färdiga vävnadsmikroarrayer istället för att producera sina egna för att undvika fel när de förbereder sina egna vävnadsmikroarrayer. Ett annat övervägande är antalet prover som ska placeras på ett enda objektglas. Flera hundra vävnadskärnor kan placeras på ett enda objektglas, men det kan vara svårt att hålla reda på och att exakt experimentera på så många små prover.